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Die Philosophen, eine Organisation mit dem Ziel alles zu kontrollieren (Ökonomie, Politik usw.), wird durch die vereinten Mächte von Russland, China und den Vereinigten Staaten gegründet. Es ist unklar, wer die Philosophen wirklich sind.

Während des Zweiten Weltkriegs schlossen die Philosophen einen Pakt, der zur Erschaffung des 'Erbes der Philosophen' führte. Das Erbe beinhaltet 100 Milliarden Dollar, sowie die Namen der geheimen Mitglieder jener Organisation.

Nach dem Zweiten Weltkrieg wurde das Geld des Erben der Philosophen gestohlen, versteckt und über etliche Banken verteilt. Die Aufzeichnungen der Transaktionen wurden auf Mikrofilm festgehalten. Wer auch immer es fertigt bringt den Mikrofilm in seinen Besitz zu bringen, kann sich Zugriff zum Erbe verschaffen. Natürlich haben Russland, China und die Vereinigten Staaten großes Interesse daran das Erbe zu finden um zur führenden Macht zu werden.

Nach Stalins' Mandat, wird Russland von Nikita Khrushev geführt.

Der russische Nuklearwissenschaftler Nikolai Sokolov beginnt damit, eine neue russische Nuklearwaffe zu entwickeln: den Shagohod.

Es stellt sich heraus, dass Russland Mittelstreckenraketen auf Kuba, einem ihrer allierten Länder, stationiert. Dies alarmiert die USA, da Russland potenziell einen Angriff ausführen könnte, sollten die Nuklearwaffen Kuba erreichen.

In der Zwischenzeit beginnt Nikolai Sokolov sich vor seiner eigenen Erfindung, dem Shagohod, zu fürchten und beschließt in die Vereinigten Staaten überzulaufen. Er flüchtet mit seiner Familie aus Russland, wird jedoch in Berlin erkannt und aufgehalten.

Präsident Kennedy verlangt von Russland seine Nuklearwaffen abzurüsten, doch Russland lehnt dies ab. Die USA und Russland werden in Alarmbereitschaft versetzt und bereiten sich auf einen zukünftigen Nuklearkrieg vor. Letztendlich entscheidet sich Russland ihre Waffen abzurüsten, verlangen jedoch im Gegenzug, dass Sokolov nach Russland zurückkehrt. Sokolov wird zurückgeschickt und fährt mit seiner Arbeit am Shagohod fort.

Die CIA gründet die FOX (Force Operation X) Einheit, eine Gruppe die geheime Spezialmissionen ausführen soll. FOX wird von einem Mann namens Major Zero geleitet.

Um FOX taktische Unterstützung leisten zu können, erschafft Major Zero die Militäreinheit XOF und setzt einen Mann namens Skull Face an die Spitze.

Die Vereinigten Staaten schicken The Boss, ihre beste Agentin, nach Russland mit dem Ziel das Erbe der Philosphen zu finden.

FOX schickt den Geheimagenten Naked Snake nach Russland, mit dem Ziel Sokolov zu finden und zu retten, und dabei den Shagohod zu zerstören. Die Mission ist als 'Virtuose Mission' betitelt. Während der Mission wird Naked Snake per Funk durch die FOX Mitglieder: Major Zero, Sigint und Para-Medic, unterstützt.

Kurz bevor er seine Mission abschließen kann, wird Naked Snake von seiner Mentorin, The Boss aufgehalten. Es scheint so als ob Boss abtrünnig geworden ist und die Vereinigten Staaten verraten hat.

Russland wird militärisch von der GRU Spetsnaz repräsentiert. Eine Rebellengruppe der GRU SpezNas, geführt von Oberst Volgin, ziehlt darauf sich gegen den sovietischen Premierminister Nikita Khrushchev zusetzen.

The Boss gibt Russland einen amerikanischen Nuklear-Sprengkopf, der von Colonel Volgin verwendet wird, um eine russische Forschungsanlage zu zerstören. Dadurch scheint es so, als ob die Vereinigten Staaten Russland angegriffen hätten, ein brillianter Schachzug der von Russland selbst durchgeführt wurde.

Die Vereinigten Staaten müssen nun Russlands Präsidenten Khrushchev beweisen, dass sie nichts mit dem Anschlag, der von The Boss und Volgin durchgeführt wurde, zu tun haben. Deshalb entscheiden sie sich Naked Snake zurück nach Russland zu schicken, mit dem Ziel Khrushchev's Anforderung zu erfüllen und The Boss, die Mentorin von Naked Snake, und Oberst Volgin auszuschalten. Die Mission 'Operation Snake Eater' beginnt.

Major Zero beschließt im geheimen Skull Face, den Anführer von XOF, zu entsenden, um Naked Snake während der Mission zu unterstützen. Niemand sonst weiß von Skull Faces Beteiligung während dieser Geschehen.

Der KGB setzt die FOX Einheit mit zwei NSA Agenten zusammen, die 1960 nach Russland überliefen: ADAM und EVA. ADAM wird Naked Snake helfen Informationen zu sichern und letztendlich zu flüchten.

Am Treffpunkt erscheint nur EVA und gibt bekannt, dass sie an Stelle von ADAM geschickt wurde. Naked Snake und EVA werden von einer Militäreinheit, die von Ocelot geführt wird, angegriffen. Ocelot nimmt EVA als Geisel, wird aber besiegt und zieht sich letztendlich zurück.

Naked Snake und EVA finden heraus, dass Volgin im Besitz des Erbes der Philosophen ist.

Bei seiner Mission den Shagohod zu finden, stellt sich Naked Snake allen Mitgliedern, bis auf The Boss, der Cobra Unit: The Pain, The Fury, The End, The Fear und The Sorrow entgegen und besiegt sie. Während eines Verhörs, das von Volgin, The Boss und Ocelot durchgeführt wird, wird Naked Snake von einer Kugel getroffen und verliert sein rechtes Auge.

Naked Snake zerstört den Shagohod und besiegt Oberst Volgin.

Was Naked Snake allerdings nicht weiß, ist dass EVA in Wirklichkleit eine Spionin der chinesischen Regierung ist, welche ebenfalls ihre Hände an das Erbe der Philosophen legen will. EVA gelingt es schließlich sich den Mikrofilm anzueignen, welcher sich im Nachhinein als Fälschung herausstellte. Der echte Mikrofilm wird von Ocelot erworben, einem Dreifach-Agenten der für die Philosophen arbeitete. In Wahrheit war Ocelot ADAM, worüber keiner Bescheid wusste.

Ocelot gibt das Erbe an die Vereinigten Staaten, wobei nur die Hälfte wiederhergestellt wird. Es wird vermutet, dass die andere Hälfte in den Händen des KGB liegt.

Naked Snake findet heraus, dass The Boss die Vereinigten Staaten nicht absetzte, sondern von Anfang an ihre Befehle befolgte. Ihr wurde von der Regierung befehligt, Volgins Vertrauen zu gewinnen, indem sie ihm den nuklearen Sprengkopf gibt. Das Ziel war jedoch von Anfang an Zugang zum Erbe zu bekommen. Was sie jedoch nicht annahmen ist, dass Volgin wirklich den nuklearen Sprengkopf benutzten würde um eine russische Forschungsstation zu zerstören und damit die Vereinigten Staaten zu beschuldigen. Jetzt verbessert die Vereinigten Staaten die Mission von The Boss, indem sie ihre Role weiter spielt und wartet bis sie von Naked Snake getötet wird. Damit die Vereingiten Staaten nicht beschuldigt werden können. Sie war eine Heldin für ihr Land, wird jedoch nur als Betrügerin in Erinnerung bleiben.

Die Vereinigten Staaten verleihen Naked Snake den neuen Titel: Big Boss.

Gezwungen sein Dasein im Schatten zu verbinden, entwickelt Skullface einen Hass für Major Zero und Naked Snake.

Ocelot redet mit dem Chef der KGB über Telefon und diskuttiert die Role von Nikita Khrushchev. Khrushchev wird schliesslich später von seinem Dienst suspendiert.

Verärgert darüber was die Regierung ihm und The Boss angetan hat, verlässt Big Boss FOX und kurz darauf auch Major Zero, der Kopf der Militärgruppe.

Gene tritt der FOX Unit bei und wird, unter dem Decknamen Viper, ihr Anführer.

Während des mosambikanischen Unabhängigkeitskriegs wird Big Boss, nun ein Söldner, vertraut mit Frank Jaeger, einem sehr jungen Kindersoldaten. Er steckt ihn in eine Reha-Einrichtung, im Glauben er wäre dort sicher.

In dieser Rehabilitationseinrichtung, wird Frank Jaeger jedoch von der CIA festgenommen und als Testobjekt benutzt. Er wurde einer Gehirnwäsche unterzogen und ihm wurde den Kodenamen NULL zugeteilt.

Gene transformiert die FOX Einheit zu einer untreuen Gruppe, die jetzt unabhängig von der CIA handelt. Die FOX Einheit hat jetzt vor die andere Hälfte der Philosophen auf zu finden.

Big Boss wird von Gene gefangen genommen. Während seiner Gefangenschaft freundet sich Big Boss mit Roy Campbell an.

Big Boss gelingt die Flucht, doch die Vereinigten Staaten unterstellen ihm und Major Zero die Umwandlung von FOX in eine Gruppe von Deserteuren.

Big Boss und Roy Campbell, zusammen mit Major Zero, Para-Medic und Sigint, gründen die unabhängige Organisation FOXHOUND, mit dem Ziel Ihre Namen reinzuwaschen und die übrigen Mitglieder von FOX zu beseitigen.

Big Boss trifft auf Null, nun ein Mitglied der Deserteure der FOX Unit, erkennt ihn aber nicht vollständig. Sie kämpfen und Big Boss wird gefangen genommen.

Während der Mission erhält Big Boss Informationen darüber, dass FOX im Besitz eines Metal Gear, namens RAXA, ist.

Big Boss findet und zerstört Metal Gear RAXA, welcher sich später nur als Testmodell herausstellt.

Als Big Boss sich auf den Weg macht den echten Metal Gear zu zerstören, begegnet er Null noch einmal. Big Boss erkennt ihn als Frank Jaeger wieder, jedoch will Null ihm diese Geschichte nicht abkaufen. Nach dem Kampf wurde Null besiegt und glaubt Big Boss wieder. Er erinnert sich wieder an seine wahre Identität, Frank Jaeger.

Big Boss besiegt Gene, welcher ihm den gesamten Besitz der FOX Unit gibt. Er enthält unter anderem Geld, Soldaten und die Pläne eine neue Militärnation zu erschaffen.

Big Boss stoppt den geplanten Nuklearanschlag durch Metal Gear. Die Mission ist offiziell abgeschlossen.

In der Zwischenzeit plant Ocelot die Kontrolle über beide hälften des Erbes der Philosophen zu übernehmen. Er tötet den Kopf der CIA und erhält so die zweite Hälfte des Erbes und eine Liste mit namen der Philosophen.

Zusammen mit Major Zero, Para-Medic und Sigint, schließt sich Big Boss erneut FOX an.

Major Zero, Ocelot und Big Boss benutzen das Erbe um die Philosophen neu zu gestalten.

Das Ziel der Patriots ist es den Traum von Big Boss, eine vereinte Welt, zu erfüllen.

Major Zero beginnt Geschichten über Big Boss zu verbreiten. Manche davon sind wahr, andere falsch. Spannungen zwischen den beiden entstehen.

Die Navajo Nation in den Vereinigten Staaten ist reich an Uranerz, welches für Nuklearwaffen benutzt werden könnte.

Code Talker studiert ebenfalls die Überreste von The End, einem Mitglied der Cobra Unit und entdeckt dabei, dass die Parasiten seine Fähigkeiten verbessert haben. Diese Parasiten existieren in verschiedenen Formen. Eine davon sind die Stimmbandparasiten, welche in der Lage sind Menschen zu infizieren, die eine bestimmte Sprache sprechen. DIe Philosophen versuchten die Parasiten zu replizieren, haben dieses Vorhaben jedoch aufgegeben.

Während des Kalten Krieges stirbt eine Frau, während sie ihren Sohn gebärt. Eines Tages erkennt dieses Kind, genannt Tretij Rebenok, seine psychischen Kräfte beim gelungenen Versuch die Gedanken seines Vaters zu lesen. Er erfährt so, dass sein Vater ihn auf den Tod hasst. Aufgebracht darüber, tötet das Kind seinen Vater und brennt das gesamte Dorf nieder.

Der ehemalige Anführer der Sowjet Union, Nikita Chruschtschow, stirbt an einem Herzinfarkt.

Major Zero startet ein Geheimprojekt, gennant Les Enfants Terrible, mit dem Ziel Klone vom größten Soldaten aller Zeiten, Big Boss, zu erschaffen.

Die Zwillingsbrüder Liquid Snake und Solid Snake werden geboren. Sie sind als unvollkommene Klone zu verstehen. Ein dritter, perfekter Klon wird erschaffen: Solidus Snake.

Allen Klonen werden Gene zur beschleunigten Alterung gegeben, um zu verhindern das sie gegen die Patriots eingesetzt oder sich auflehnen können.

Big Boss findet über das Projekt heraus und ist vollkommen empört. Big Boss glaubt das Major Zero und die Patriots das eigentliche, wundervolle Vorbild von The Boss fehlinterpretiert haben.

Big Boss verlässt die Patriots. Major Zero nennt sich und seine Organisation in Cipher um.

Big Boss erschafft seine eigene militärische Söldnergruppe namens Militaires Sans Frontieres. Ihr Ziel ist es jedem militärische Kraft zu bieten, der sie benötigt, Gleich welcher Herkunft oder Ideologie.

Es stellt sich heraus das Costa Rica von einer unbekannten militärischen Streitkraft, mit wahrscheinlichem besitz von Nuklearsprengköpfen, unterdrückt wird.

Big Boss und die Militaires Sans Frontieres werden von der Streitmacht Costa Ricas, repräsentiert von Galvez und Paz, gefragt ob sie eingreifen und damit diese Militärarmee stoppen können. Im Gegenzug bieten sie Big Boss eine funktionsfähige Basis im karibischem Meer an, genannt Mother Base.

Big Boss akzeptiert den Handel und begibt sich nach Costa Rica, wo er über Hörfunk von der Militaires Sans Frontieres und deren Unteroffizier Kaz Miller unterstützt wird. Big Boss bekommt eine Bestätigung, dass sich dort nukleare Sprengköpfe befinden.

Big Boss trifft Amanda, die Anführerin des Widerstands in Costa Rica. Sie bestätigt, dass die gegnerischen Streitmächte von der CIA unterstützt werden. Ihr Bruder, Chico, wird von einer Drone entführt. Big Boss überzeugt Amanda der Militaires Sans Frontiers beizutreten und beginnt mit der Mission Chico zu befreien und die nuklearen Sprengköpfe ausfindig zu machen.

Big Boss befreit Chico, der daraufhin ebenfalls der Militaires Sans Frontieres beitritt. Big Boss fährt mit seiner Mission fort, die nuklearen Sprengköpfe zu suchen. Es wird bekannt, dass Hot Coldman, ein CIA Agent , den vom Wissenschaftler Huey Emmerich entwickelten Metal Gear benutzten will, um einen Sprengkopf zu starten und seine Wirksamkeit zu testen.

Coldmann greift Huey Emmerich an, welcher später von Big Boss Hilfe bekommt. Emmerich enthüllt Coldmans Plan. Coldmans Armee besitzt einen Metal Gear, Deckname Peace Walker, der dazu fähig ist, ohne menschlichen Eingriff, gezielt nukleare Gegenschläge auf Feinde auszuführen. Die KI dieses Metal Gear , entwickelt von der Wissenschaftlering Dr. Strangelove, wurde nach den Charakterzügen von The Boss geformt.

Big Boss muss Hot Coldman stoppen. Huey Emmerich tritt Militaires Sans Frontieres bei.

Hot Coldman versucht die KI des Peace Walker zu hacken, damit dieser Militaires Sans Frontières angreift.

Es wird enthüllt, dass Galvez (welcher richtiger Name Zadornov ist) mit Coldman zusammen arbeitete, aber nun plant Coldman zu verraten. Zadornov möchte Peace Walker benutzen um Cuba (Verbündete der UdSSR) von einer US Basis aus anzugreifen. Diese Aktion würde USA beschuldigen, damit Nord und Süd trennen und damit einen starken Vorteil für die UdSSR darbringen.

Zadornov schießt auf Hot Coldman und zwingt Dr. Strangelove die KI umzuprogrammieren um Kuba anzugreifen. In Wahrheit programmiert er sie, einen gestellten Nuklearangriff gegen Cuba zu starten und lässt es so aussehen, als käme der Angriff von Russland.

Die Vereinigten Staaten sind bereit, mit ihrer nuklearischen Macht, anzugreifen.

Der Peace Walker, getrieben vom Willen der KI von The Boss, opfert sich selbst, indem es sich in einem Fluss ertränkt. Dabei zerstört es das Signal und verhindert somit einen Nuklearkrieg.

Die Mission ist beendet und mit der Hilfe von Miller und den Wissenschaftlern Huey Emmerich und Dr. Strangelove, kehrt Big Boss zurück zur Mother Base und beginnt die Arbeit am eigenen Metal Gear, genannt ZEKE.

Paz stiehlt und kontrolliert den Metal Gear ZEKE, und behauptet den Metal Gear zurück zu ihrem Anführer Cipher zu bringen. Paz beschuldigt Big Boss den falschen Weg eingeschlagen zu haben, seitdem er sich vor zwei Jahren von dem Gründer der FOX Einheit Major Zero trennte.

Paz bittet Big Boss ihnen beizutreten, doch er lehnt es ab. Paz plant den Metal Gear zu benutzen, um Nuklearsprengköpfe auf die Vereinigten Staaten zu schicken, um somit Big Boss und den Militaires Sans Frontieres die Schuld für den Angriff zuzuschieben.

Dr. Strangelove verlässt Militaires Sans Frontieres als ihre KI Entwicklungsfortschung nicht mehr benötigt wird.

Miller enthüllt Big Boss, dass Cipher in Wahrheit Major Zero ist.

Big Boss erzählt seinen Truppen dass sie unter jedem dienen werden, obgleich welcher Nation oder Ideologie und sie würden bald eine Nation erbauen welche sie ihr eigen nennen können, genannt Outer Heaven.

Es wird enthüllt, das all diese Vorkommnisse von Cipher inszeniert wurden welcher wusste, dass Big Boss der Einzige in der Lage war, Mother Base zu bauen und eine solch enorme, militärische Streitkraft zu züchten. Ihr Ziel war es, die Kontrolle über Mother Base zu übernehmen, weshalb Paz versuchte Big Boss davon zu überzeugen, Cipher anzuschließen.

Skull Face, der Anführer von XOF, trifft Code Talker, welcher finanzielle Mittel für seine Mikrobenforschung braucht. Skull Face, ohne Erlaubnis von Major Zero, finanziert Code Talkers Forschung, zwingt ihn aber das Potenzial der Mikroben in Hinsicht auf Nuklearforschung zu studieren. Die Forschung führt zur Entwicklung verschiedener Mikroben (ebenfalls "archaea" genannt) welche verschiedene, verstärkende Eigenschaften beinhalten, nützlich für militärische Zwecke.

Die IAEO (Internationale Atomenergie-Organisation) sendet eine Nachricht an die Militaires Sans Frontieres und erbittet eine Inspektion der Mother Base. Big Boss und Kaz Miller glauben es handle sich um ein Manöver von Cipher, um den nuklearen Sprengkopf des Metal Gear ZEKE ausfindig zu machen, als Rachezug für die des vergangenen Jahrs.

Big Boss und Kaz Miller finden heraus, dass Paz die Explosion überlebte und wollen sie entführen, mit der Hoffnung vertrauliche Daten über Cipher herauszufinden. Sie schicken Chico auf eine Expedition um seine Schwester zu finden. Sie schicken Chico auf eine Expedition um seine Schwester zu finden, doch er schleicht sich davon und versucht, auf eigene Faust, Paz zu retten. Er wird schließlich gefangen genommen und zusammen mit Paz, im Camp Omega, in Ketten gelegt.

Chico wird einer schrecklichen Folter ausgesetzt die von Skull Face, dem Anführer der XOF, durchgeführt wird. Daraufhin gibt sich Chico geschlagen und offenbart Skull Face alle vertraulichen Informationen über die Militaires Sans Frontieres und deren Mother Base, ebenso den aktuellen Standpunkt des Metal Gear ZEKE. Skull Face fordert Chico auf, ein SOS Signal an die Mother Base zu schicken.

Skull Face findet heraus, dass Paz die einzige Cipher Agentin ist, die sich je mit Cipher persönlich treffte und foltert sie um seinen genauen Standpunkt ausfindig zu machen. Skull Faces Ziel ist es sich von Cipher zu befreien. Er lässt zwei Sprengsätzte in Paz Körper einsetzten um die Wahrscheinlichkeit eines Rettungeinsatzes zu verhindern.

Big Boss und Miller verstehen, dass das Signal eine Falle sein könnte. Nichtsdestotrotz entscheiden sie die Rettungsmission zu starten.

Big Boss findet Chico in Panik vor. Um ungewollte Aufmerksamkeit zu vermeiden, betäubt Big Boss ihn und ruft einen Helikopter um ihn zur Mother Base zu schicken.

Big Boss fährt mit seiner Mission fort und findet Paz schliesslich und befreit sie. Zurück auf dem Helikopter findet Big Boss heraus, dass sich eine Bombe in Paz Körper befindet und kann diese mithilfe eines Artztes entfernen.

Als sie näher an Mother Base kommen, finden sie heraus das sie von XOF angegriffen wird. Mother Base stürzt ein und es scheint, dass Big Boss, Miller und der Arzt die einzigen überlebenden der Militaires Sans Frontieres sind.

Im Helikopter enthüllt Paz, dass sich eine zweite Bombe in ihrem Körper befindet. Darauf hin springt aus dem Helikopter und explodiert. Durch die Explosion kollidiert der Helikopter mit einem Helikopter der XOF, woraufhin Big Boss ins Koma fällt.

Jeder glaubt es gibt keine Überlebenden. Major Zero kontaktiert EVA und bittet sie Big Boss, Miller und den Arzt in ein Krankenhaus auf Zypern zu bringen.

Es scheint als ob Huey Emmerich der XOF erlaubt hat diesen Angriff zu starten. Huey wird von Skull Face entführt und wird gezwungen der XOF beizutreten und an deren neuem Metal Gear zu arbeiten.

In der Zwischenzeit birgt Dr. Strangelove die KI des Peace Walkers und beginnt mit der Arbeit an der KI die Major Zero plant zu bauen.

Skull Face, der PAZ zwang die genaue Position von Major Zero preiszugeben, sendet Major Zero ein Paket, welches die Stecknadel von The Boss beinhaltet, jedoch von einem Parasiten infiziert ist. Major Zero sticht sich aus Versehen mit der Stecknadel und wird infiziert. Dies wird zu Skull Faces persönlichem Rachezug, weil er unter der Kontrolle von Major Zero gehalten wurde.

Von diesem Augenblick an, kümmert sich Ocelot um Big Boss und den Arzt, welche nach dem Absturz im Koma liegen.

Liquid Snake wird von Cipher verlassen und nach England geschickt.

Es gibt keine Spur von Major Zero.

Während des Rhodesischem Bürgerkrieges, tötet Frank Jaeger ein junges Paar. Als er entdeckte, dass sie eine Tochter hatten, fühlte er sich schuldig und entscheidet sich , sich um das Kind zu kümmern. Er gibt ihr den Namen Naomi Hunter. Sie wird nie erfahren, dass Frank Jaeger der Mörder seiner Eltern ist.

Die Sowjetunion fällt in Afghanistan ein. Miller, der von den Vereinigten Staaten finanziert wird, trainiert den afghanischen Widerstand. Nach dem Mother Base Zwischenfall, verlor Miller ein Arm und ein Bein.

Während dem Krieg zwischen den zwei Fraktionen, erkennen sowjetische Soldaten die brutalen Kräfte von Quiet an, einer Attentäterin die später von XOF angeworben wird.

Huey Emmerich, der jetzt für XOF arbeitet, heiratet Dr. Strangelove und sie bekommen bald ein Kind, namens Hal. Huey benutzt Hal als Versuchskaninchen für seine neue KI im Metal Gear Sahelanthropus. Es kommt zum Streit zwischen ihm und Dr. Strangelove, welche schliesslich von Huey in die Hülle der KI eingesperrt wird. Dr. Strangelove stirbt später durch Ersticken.

Tretij Rebenok, das übersinnliche Kind, das in den frühen 70ern geboren wurde, wird von der Soviet Union gefangen genommen und in ein Labor gebracht, wo Individien mit einzigartigen Kräften untersucht werden. In dem gleichen Gebäude wird zeitgleich der komatöse Körper von Oberst Volgin untersucht. Der Wunsch sich an Big Boss zu rächen, hält ihn am Leben. Die Präsenz von Tretij lässt ihn komplett erwachen und verwandelt ihn in den Man on Fire.

Big Boss erwacht aus dem Koma. Er hat jetzt eine Prothese als Arm und ein Schrapnel, dass aus der Stirn ragt.

XOF bekommt mit, dass Big Boss sich in einem Krankenhaus auf Zypern aufhält. Ihr Ziel ist es nun Big Boss zu töten und jede Spur ihrer Beteiligung zu verwischen. Sie schicken Quiet, um Big Boss loszuwerden.

Während Quiet versucht Big Boss zu erwürgen, wird sie von einem anderen Patienten namens Ishmael unterbrochen, welcher sie dann in Brand setzt. Quiet geht in Flammen auf und fällt aus dem Fenster.

Big Boss versucht mit der Hilfe von Ishmael aus dem Krankenhaus zu flüchten. Das unerwartete Erscheinen von Tretij und dem Mann aus Feuer, welche beide Big Boss tot sehen wollen, sabotiert unabsichtlich die Mission der XOF Einheit.

XOF scheitert an ihrer Mission, schafft es jedoch jegliche Spuren ihres Mitwirkens in dieser zu verschleiern. Big Boss, nun auch unter dem Namen Venom Snake bekannt, gelingt es dank Ocelot zu fliehen, welcher ihn anschließend nach Afghanistan schickt. Seine Mission ist es, Mother Base wieder aufzubauen und ihre neue Militäreinheit, genannt Diamond Dogs, zu führen.

Quiet wird einer medizinischen Parasiten-Behandlung unterzogen, wodurch sie am Leben erhalten wird und zusätzlich die Fähigkeit entwickelt durch ihre Haut zu atmen.

Venom Snake findet und befreit Miller, welcher in einem sowjetischem Außenposten gefangen gehalten wurde.

Venom Snake wird auf die Mission geschickt Quiet zu finden. Nachdem seinem Sieg, nimmt er sie gefangen und bringt sie auf Mother Base, wo sie als Gefangene gehalten wird.

Venom Snake findet und befreit Huey Emmerich, wird jedoch von dem Metal Gear Sahelanthropus angegriffen, welcher von Tretij gesteuert wird. Venom Snake zerstört schlussendlich Teile von dem Metal Gear und es gelingt ihm zur Mother Base zu flüchten.

In der Zwischenzeit beginnt Quiet Venom Snake auf jeglichen Missionen zu helfen und es entsteht eine gewisse Verbundenheit zwischen ihnen.

Als Venom Snake gerade auf der Suche nach dem Anführer einer Kindersoldatengruppe ist, landet er in einer Einrichtung, wo Experimente an Menschen durchgeführt werden. Nach einem kurzen Aufeinandertreffen mit Skull Face, wird Venom Snake vom 'brennenden Mann" und Tretij angegriffen. Venom gelingt es jedoch zu fliehen.

Venom Snake findet Liquid Snake (als Eli bekannt), der jetzt Anführer einer Kindersoldatengruppe ist. Eli wird von Venom Snake auf die Mother Base gebracht. Eli ist sehr wütend auf seinen Vater. So sehr, dass er versucht (erfolglos) diesen zu töten.

Venom Snake und Ocelot führen DNA Tests durch, um die Verwandschaft von Eli und Venom Snake sicherzustellen. Die Tests fallen negativ aus.

Eine schreckliche Seuche hat sich auf der Mother Base verbreitet, mit dem Resultat, dass viele Mitarbeiter sterben. Um ein Gegenmittel zu finden, macht sich Venom Snake auf eine Mission um Code Talker zu finden. Code Talker wurde von Skull Face benutzt um den Stimmband Parasiten zu entwickeln. Der Parasit infiziert nur erwachsene Menschen, die eine spezifische Sprache sprechen.

Venom Snake findet und befreit Code Talker, welcher ihm die Wobachia Bakterie, das Heilmittel für die Seuche, überreicht. Code Talker glaubt, dass die Absicht von Skull Face darin liegt mit dem Parasiten alle Sprachen bis auf Englisch auszulöschen, als ethnische Säuberung.

Skull Face enthüllt seinen Plan. Er folgt der Vision von der Welt von The Boss und will diese durch das verstummen der Menschheit erreichen. In wirklichkeit will er den Stimmband Parasiten dazu nutzen, jeden auf der Welt zu infizieren, der Englisch spricht.

Eli wird von Tretij psychisch beeinflusst und beschließt Vergeltung an Venom Snake zu nehmen. Es gelingt Eli die Kontrolle über Sahelantropus zu nehmen und verursacht große Verwüstung an den Soldaten von Skull Face und Venom Snake, welcher diesen schließlich kampfunfähig macht.

Venom Snake und Miller finden Skull Face eingeklemmt unter Trümmern und nehmen Rache für das was Skull Face der Militaires Sans Frontieres und der Mother Base angetan hat. Sie trennen mit der Waffe von Skull Face sein linkes Bein und seinen rechten Arm ab. Huey Emmerich schießt ihm anschließend in den Kopf.

Venom Snake findet und zerstört die Phiolen, die Skull Face bei sich hatte, welche den Stamm des englischen Stimmband Parasiten in sich trugen. Jedoch bemerkte niemand, dass Tretij eine der Phiolen nahm, before es jemand entdeckte.

Venom Snake, Miller und Huey erreichen Mother Base und bringen Metal Gear Sahelanthropus mit sich. Tretij gibt Eli die letzte Phiole, welche den englischen Stimmbandparasiten beeinhaltet.

Eine neue Seuche breitet sich auf Mother Base, auf er Quarantäne Plattform, aus. Später wird klar, dass Huey unbeabsichtigt die Seuche auslöste, indem er den Wolbachia Bakterie mit Beta-Teilchen bestrahlte. Mit dem Ziel einen weltweiten Krankheitsausbruch zu vermeiden, ist Venom Snake gezwungen alle Mitglieder von Diamond Dogs auf der Quarantäne Plattform zu töten.

Es taucht auf, dass Huey mit dem DARPA (in Kontakt mit Cipher) in Verbindung stand und diesen bat, ihn im Austausch für Problem des Parasiten zu retten. Huey Emmerich wird daraufhin ins Exil geschickt.

Quiet wird von einer sowjetischen Einheit festgenommen. Venom Snake kann sie ausfindig machen und befreit sie schließlich. Nach einem heftigen Sandsturm verschwindet sie wieder und hinterlässt Venom Snake eine Tonbandkassette. Auf dieser Kassette gibt sie bekannt, dass sie nie sprach, da sie den englischen Stimmband Parasiten in sich trug. Sie wollte es nie gegen Venom Snake oder die Diamond Dogs einsetzen, daher schwieg sie.

Venom Snake erhält eine Tonbandkassete, auf der er von seiner echten Identität erfährt. Venom Snake war der beste Soldat Militaires Sans Frontieres jemals hatte.Er war der Arzt, welcher zusammen mit Big Boss ins Koma fiel. Unter dem Befehl von Major Zero, benutzten die Doktoren auf Zypern plastische Chirurgie um ihn wie Big Boss aussehen zu lassen. Dadurch war es Big Boss möglich unter zu tauchen und den Grundstein für das legen, was später als 'Outer Heaven' bekannt werden sollte. Der echte Big Boss war Ishmael, der Patient welcher Venom Snake half, aus dem Krankenhaus zu fliehen.

Big Boss bat Ocelot auf Venom Snake aufzupassen und bei seinem Masterplan mitzuspielen. Durch den Einsatz von Hypnose wurde Venom Snake dazu gebracht zu glauben er sei der echte Big Boss. Seine einzigartigen Fähigkeiten erlaubten ihm, jeden um ihn herum dies glauben zu lassen. Von diesem Augenblick an lebte Venom Snake als das Phantom von Big Boss. Gleichzeitig arbeitet der echte Big Boss an der verwirklichung von Outer Heaven.

Eli flüchtet mit den anderen Kindersoldaten von der Mother Base. Mithilfe von Tretij gelingt es ihm außerdem Metal Gear zu stehlen und auf eine weit entfernte, afrikanische Insel zu flüchten. Diese Insel ist jedoch komplett von Parasiten befallen, jedoch werden Kinder von diesem nicht befallen, bis sie erwachsen sind.

Venom Snake infiltriert die Insel, wo sich bereits Soldaten von Cipher befinden, die geschickt wurden um den Metal Gear sicherzustellen. Eli aktiviert Sahelanthropus und greift Venom Snake an, welcher den Metal Gear jedoch erneut zerstört.

Diamond Dogs SOldaten treffen ein um Venom Snake zu evakuieren, da die gesamte Insel mit dem Parasiten befallen ist. Es stellt sich heraus, dasss Eli ebenfalls infiziert ist.

Tretij erscheint wieder und entfernt mit seinen übermenschlichen Fähigkeiten den Parasiten aus Eli's Körper. Sie fliegen weg, während Diamond Dogs ein Napalm Angriff auf die Insel startet, um einen nächsten Ausbruch des Parasiten zu verhindern.

Solid Snake, geschickt von den Vereinigten Staaten, kämpft im Golfkrieg.

Big Boss ist ( erneut ) der Kopf von FOXHOUND, doch die US Regierung ist davon nicht im Bilde. Die Vereinigten Staaten wissen ebenfalls nicht das Big Boss gleichzeitig der Kopf hinter Outer Heaven ist.

Outer Heaven entwickelt den TX-55 Metal Gear um die Möglichkeit zu haben Major Zero und seine Gruppe, die Patriots, zu bekämpfen.

Auflösung der Sowjetunion.

Der Oberst der GRU (der russische Militär- und Nachrichtendienst) Sergei Gurlukovich, ein Freund von Ocelot während des Kalten Krieges, gründet die militärische Gruppe, Gurlukovich Söldner. Diese Gruppe hat als Ziel Russland zu ihrem früheren Ruhms zu bringen. Er ist in gewisser Weise, für Russland das, was Big Boss für die Vereinigten Staaten ist.

Die Vereinigten Staaten finden heraus, dass Outer Heaven ihren eigenen Metal Gear bauen und beschließen FOXHOUND zu schicken um ihn zu zerstören. Big Boss allerdings steckt sowohl hinter Outer Heaven als auch FOXHOUND.

Als Kopf von FOXHOUND, sendet Big Boss Frank Jaeger, um Outer Heaven zu untersuchen.

Jaeger, unter dem Decknamen Gray Fox, versagt und wird gefangen genommen.

Big Boss schickt Solid Snake, einen der besten US Agenten, um Gray Fox zu retten.

Solid Snake rettet Gray Fox und setzt seine Mission fort, Metal Gear zu zerstören.

Big Boss enthüllt, dass er der Anführer von Outer Heaven ist und versucht Solid Snake zu stoppen. Er offenbart ebenfalls, dass er die Kontrolle über FOXHOUND zurück hat, um Solids Mission zu verzögern und um den Bau von Metal Gear fertig zu stellen.

Solid Snake zerstört Metal Gear und die gesamte Basis. Big Boss, welcher Venom Snake ist, stirbt. Der wahre Big Boss zieht sich, zusammen mit seinen Soldaten, in den mittlereren Osten zurück.

Roy Campbell ersetzt Big Boss als Anführer von FOXHOUND.

Big Boss hilft Sansibar, die Unabhängigkeit von Russland zu erreichen.

Eine gewaltige Ölkrise bricht aus. Mit dem Ziel das Problem zu lösen entwickelt Dr. Kio Marv ein synthetisches Erdöl.

Dr. Kio Marv wird von Soldaten in Zanzibar gefangen genommen, um damit die komplette Kontrolle über das synthetische Öl zu bekommen. Mit dem Ziel zu verhindern, dass Dr. Kio Marv flüchten oder befreit wird, wird das gesamte Territorium mit MetalGears mobilisiert.

Roy Campbell, nun der Anführer von FOXHOUND, schickt Solid Snake auf eine neue Mission, diesmal um Dr. Kio Marv zu retten.

Solid Snake findet heraus, dass Big Boss während der Ereignisse von 1995 überlebte und dass Dr. Kio Marv tot ist. Jedoch findet er die Formel für das synthesische Öl.

Solid Snake wird von Gray Fox angegriffen, der den MetalGear D steuert. Solid Snake zerstört den MetalGear und kämpft gegen Gray Fox in einem Minenfeld.

Solid Snake tötet Gray Fox und wird danach von Big Boss angegriffen. Solid Snake gewinnt diesen Kampf.

Kurz bevor er stribt enthüllt Big Boss, dass er der Vater von Solid Snake ist.

Die Patriots bergen die Leiche von Big Boss und Major Zero lässt ihn, dank der Hilfe von Nanomaschinen, in ein kryogenisches Koma fallen. Sein Ziel ist es, die Gene von Big Boss zu benutzen, um die Leistung und Fähigkeiten jeden einzelnen Soldaten zu verbessern.

Ocelot, nicht einverstanden mit diesem Plan, beginnt sich gegen Major Zero und den Patriots zu verschwören.

Roy Campbell verlässt FOXHOUND.

Liquid Snake tritt FOXHOUND bei und übernimmt bald die Kontrolle.

Major Zero, der anfängt alt zu werden, beginnt anderen zu misstrauen und will nicht, dass irgendjemand die Kontrolle über die Patriots übernimmt.

Major zero gibt den Auftrag eine fortgeschrittene KI, unter dem Namen "The System", zu entwickeln. Diese KI besteht aus vier verschiedenen KIs, die von einem Master Ki gesteuert werden.Mit diesem System sollen dann die Patriots gesteuert werden.

Solidus Snake inszeniert die bevorstehende Shadow Moses Affäre.

Dr. Naomi Hunter entwickelt das Virus FOXDIE, welches die Kraft besitzt eine spezifische Person, anhand deren DNA und desen Nanomaschine zu töten. Naomis eigentlicher Plan ist es, damit Solid Snake zu töten, welcher Gray Fox(Frank Jaeger, welcher Naomi adoptierte und aufzog) tötete.

FOXHOUND, jetzt unter der Leitung von Liquid Snake, leitet einen bewaffneten Aufstand auf Shadow Moses, in Alaska. Sie besitzen Metal Gear REX und drohen den Vereinigten Staaten mit einem nuklearen Angriff, wenn sie nicht inerhalb von 24 Stunden die Leiche von Big Boss und 1 Milliarde Dollar überreichen.

Roy Campbell, der seit 2000 nicht mehr Mitglied von FOXHOUND ist, schickt Solid Snake auf eine Mission um den DARPA Anführer sowie den Präsident des ArmsTech zu lokalisieren. Sie sollen Solid Snake bestätigen ob Liquid Snake wirklich in der Lage ist einen nuklearen Angriff zu starten.

Solid Snake findet den Chef von DARPA, welcher kurz darauf durch einen Herzinfarkt stirbt.

Solid Snake findet den ArmsTech Präsident, welcher von Ocelot (jetzt auf Liquids Seite) festgenommen worden ist. Ocelot duelliert SolidSnake zu einem Revolver Duell. Am Ende des Kampfes erscheint ein Cyborg Ninja, welcher Ocelots Arm abtrennt.

Während der ersten Hälfte der Mission, befreit Solid Snake Meryl Silverburgh (Tochter von Roy Campbell) und den Wissenschaftler Hal Emmerich (Sohn von Huey Emmerich, welcher Big Boss an der Konstruktion von Metal Gear ZEKE 1947 unterstützte).

Hal Emmerich, unter dem Namen Otacon bekannt, entwickelt zu diesem Zeitpunkt Metal Gear REX, ohne zu Wissen dass es einen nuklearen Sprengkopf besitzt. Nachdem er von Solid Snake aufgeklärt wurde, entscheidet er Solid Snakes Entscheidung beizutreten.

Solid Snake hat eine weitere Begegnung mit dem Cyborg Ninja. Nach einem intensivem Kampf entdeckt er die wahre Identität. Gray Fox ist Frank Jaeger.

Solid Snake erfährt von einem neuen Teil des Plans von Liquid Snake. Er möchte Sergei Gurlukovich Söldner beitreten, Shadow Moses in ein neues Outer Heaven verwandeln und damit den Traum von Big Boss verwirklichen, eine Welt mit freien Soldaten zu erschaffen.

Solid Snake findet schliesslich Metal Gear REX, welcher von Liquid Snake gestuert wird. Gray Fox kommt wieder dazwischen und zerstört ein Teil von Metal Gear REX, mit dem Ziel SolidSnake zu helfen. Gray Fox wird von Liquid Snake zu Tode zerdrückt

Solid Snake zerstört Metal Gear REX und liefert sich einen Faustkampf mit Liquid Snake. Liquid beschließt wegzulaufen, stirbt jedoch während der Flucht im Jeep an einem Herzinfarkt.

Solid Snake, welcher mit Naomi Hunter diskutiert erfährt, dass er seit Anfang der Mission mit FOXDIE infiziert wurde und nur noch wenige Jahre zu leben hat. Sie wusste nicht, dass Frank Jaeger noch lebt und wollte als Rachezug Solid mit dem Virus töten.

Nach den Ereignissen auf Shadow Moses, berichtet Revolver Ocelot (einziges überlebendes Mitglied von FOXHOUND) dem Präsidenten der Vereinigten Staaten, dass er als Doppel Agent gearbeitet hat und somit DAten von Metal Gear REX für die Vereinigten Staaten sammeln konnte.

Revolver Ocelot enthüllt die echte Identität des Präsidenten, welches sich um den dritten Klon von Big Boss handelt, nämlich Solidus Snake. Solidus Snake wurde 2001 von den Patriots als Präsident von den Vereinigten Staaten eingesetzt, ohne irgendjemanden seine echte Identität zu verraten.

Nastasha Romanenko, welche Solid Snake auf seienr Mission unterstützte, publiziert ein Buch mit dem Titel "Die Dunkelheit auf Shadow Moses: Die unoffiziele Wahrheit", in der sie alle Ereignisse auf Shadow Moses enthüllt, ausserdem Solid Snakes Beteiligung am Geschehen.

Solidus Snake ist gezwungen von seiner Position als Präsident der Vereinigten Staaten zurückzutreten und versteckt sich zusammen mit Ocelot.

Ocelot implantiert sich Liquid Snakes Hand. Nach der Operation scheint es, als ob Liquids Verstand versucht die Kontrolle über Ocelots Körper zu übernehmen.

Solid Snake und Otacon gründen Philanthrophy, eine nicht-staatliche Organisation, mit dem Ziel die Entwicklung neuer Metal Gear Modelle zu stoppen.

Solid Snake und Otacon werden mitgeteilt, dass ein neuer Metal Gear, unter dem Namen Metal Gear RAY, mithilfe von einem Tankschiff durch die Vereinigten Staaten transportiert wird. Die Informationen wurden ihnen von Emma Emmerich, die Stiefschwester von Otacon, mitgeteilt.

Solid Snakes Mission ist es das Tankschiff zu infiltrieren und Fotos vom neuen Metal Gear zu machen, um der Welt seine Existenz zu beweisen.

Nachdem Solid Snake den Tanker infiltriert hatt, wird dass Schiff von einer russischen Militäreinheit übernommen. Es handelt sich dabei um die Söldnergruppe die seit 1991 von Sergei Gurlukovich angeführt wird.

Solid Snake trifft auf Sergie Gurlukovichs Tochter, Olga Gurlukovich, und kämpft mit ihr. Sie entschloss auf dem Tankschiff zu bleiben obwohl sie schwanger war.

Nach dem Sieg über Olga, erscheint eine US Drohne am Himmel und fotografiert Solid Snake, welcher sich jetzt in der Position befindet von den Vereinigten Staaten inkriminiert zu werden.

Solid Snake infiltriert das Tankschiff und macht Bilder vom Metal Gear, während der US Marine Kommandant, Scott Dolph, eine Rede an seine Soldaten hält.

Zum Erstaunen aller, erscheint nach der Ansprache Revolver Ocelot, der seinen Plan enthüllt Metal Gear RAY mitzunehmen.

Sergei Gurlukovich taucht ebenfalls auf und nimmt Scott Dolph als Geisel.

Sergei Gurlukovich erklärt seinen Plan, Metal Gear RAY an Russland zu verkaufen, mit dem Ziel ihr zu ursprünglichem Ruhm zu verhelfen.

Wiedereinmal, gibt Ocelot überrraschend bekannt dass dies nicht sein Plan sei. Sergei Gurlukovich nimmt an, dass Ocelot noch immer mit Solidus Snake arbeitet und Ocelot gibt bekannt, dass er mit den Patriots arbeitet.

Sergei Gurlukovich ist böse auf Ocelots Verrat und probiert Ocelot zu erschiessen, wird jedoch als Erstes von Ocelot, der schneller seine Waffe zieht. Ocelot tötet damit Gurlukovich, seine Soldaten sowie Scott Dolph. Dannach löst er die Sprengsätze auf dem Tankschiff aus und flüchtet an Bord des Metal Gear RAY.

Solid Snake wird angeklagt, Metal Gear RAY gestohlen zu haben, wodurch er gezwungen wird sich zu verstecken.

Manipuliert von den Patriots, verbretiten die Medien das Gerücht, dass Solid Snake sich von den Terroristen überfallen lies und damit den Öltanker aufgeben musste. Wegen der Gefahr einer Umweltkatastrophe schickte die Navy Marines los um die Gefahr auszuschalten. Die Medien berichteten dannach, dass Snake den Tanker versenkte und damit deren Besatzung sowie sich selbst tötete. Diese Aufräumungsaktion gab den Patriots damit die gewünschte Deckung für die Big SHell aufzubauen.

Olga Gurlukovich übernimmt eine leitende Rolle in der Armee ihres Vaters. She gebärt ihre Tochter Sunny, welche als Geisel von den Patriots genommen wird, als Druckmittel um Olga weiterhin für sich arbeiten zu lassen.

Es wird bekannt, dass eine Gruppe von Terroristen, die sogenannten Sons of Liberty, Geiseln innerhalb der Big Shell gefangennahm. Der Anführer der Gruppe ist Solid Snake. Unter den Geiseln befindet sich der 44te US Präsident, James Johnson. Sons of Liberty betrohen ihn die Big Shell zu zerstören und eine riesige Umweltkatastrophe auszulösen, wenn er ihnen keine 30 Milliarden Dollar zahlt.

FOXHOUND sendet Agent Raiden zum Big Shell um die Geiseln zu retten. Hierbei wird ihm von einem Mann geholfen, der behauptet Iroquois Pliskin zu sein.

Nach einer Begegnung mit dem Anführer der Sons of Liberty wird aufgeklärt, dass er Solidus Snake ist und sich als Solid Snake ausgab, um ihm etwas in die Schuhe zu schieben. Pliskin enthüllt seine wahre Identität als Solid Snake.

Während der Mission findet Raiden heraus, dass Big Shell nichts anderes ist als ein gigantischer Metal Gear, genannt Arsenal Gear. Arsenal Gear enthält zusätzlich die KI der Patriots.

Zusammen mit der hilfe von Otacon und seiner Stiefschwester Emma Emmerich, schaffen es Raiden und Snake einen Virus, innerhalb der KI der Patriots, zu installieren.

Emma Emmerich wird von Vamp, einem der Mitglieder der Sons of Liberty, getötet.

Ocelot kommt zurück und deckt auf, dass es sich während Raidens Mission es sich nur um eine Simulation handelte, die von der KI der Patriots instrumentalisiert wurde.

Die KI der Patriots kontakiert Raiden und fordert ihn auf Solidus Snake zu töten. Andernfalls töten sie Raidens geliebte, Rosemary.

Raiden gelangt schliesslich zu dem Kern der Arsenal Gear, wo er gegen eine Serie von Metal Gear RAYs kämpfen muss. Nachdem er alle Metal Gears zerstörte begegnet er Solidus Snake, der ihm weisst macht, dass er sein Pflegevater sei.

Raiden befolgt die Befehle der KI und tötet Solidus Snake. Aufgebracht darüber manipuliert worden zu sein, schwört er die Patriots zu finden und zu töten.

Die Patriots stellen die Entwicklung des Arsenal Gear Kampfschiffes fertig. Das Kampfschiff wird von Ocelot gestohlen, und wird auf Bezugs Big Bosses Militärmacht zu Outer Heaven umgetauft. Ocelot versteckt das Kampfschiff in Shadow Moses und es gelingt ihm die KI des originalen Arsenal Gear in das Kampfschiff einzupflanzen.

Raiden befreit Sunny von den Patriots. Kurz darauf geht Sunny unter Otacons Obhut.

Ocelot wird nun komplett von Liquid Snake kontrolliert und wird nun Liquid Ocelot genannt. Solid Snake, welcher rapide altert, wird nun Old Snake genannt.

Die Welt ist jetzt komplett unter der Kontrolle von den privaten Militärbetrieben (PMC), die von Nanomaschinen verbesserte Soldaten zusammengestellt sind. Die grösste PMC ist unter Kontrolle von Liquid Ocelot.

Die UN wünscht sich Liquid Ocelot tod und glücklicherweise wegen den überzeugenden Argumente von Roy Campbell, wird Snake mithilfe von Otacon auf eine neue Mission geschickt. Mit dabei sind ausserdem Sunny und Olga Gurlukovichs Tochter.

Snakes erster Versuch Liquid Ocelot zu töten schlägt fehl. Er findet heraus das Dr. Naomi Hunter von Liquid Ocelot als Geisel festgehalten wird.

Snake befreit Naomi Hunter, welche ihm erklärte dass der FOXDIE Virus in seinem Körper mutiert. Sie erklärt ausserdem, dass Liquids Ocelots Ziel es ist Big Boss Leiche zu bergen und seine biologischen Werte auszumessen , um sich damit Zugang zu der Master KI der Patriots zu verschaffen.

Snake kämpft gegen eine Welle von Mechs, wobei ihm ein Cyborg Ninja hilft, der sich als Raiden herausstellt.

Liquid Ocelot kommt an die Leiche von Big Boss und schaltet somit alle PMCs aus, bis auf seine eigene. Sein Plan ist es nun die Patriots zu zerstören. Dafür muss er an die einzige nicht von den Patriots kontrollierte atomare Waffe gelangen, nämlich den Metal Gear REX auf Shadow Moses.

Snake infiltriert Shadow Moses und es gelingt ihm Kontrolle über Metal Gear REX zu erlangen, bevor es Liquid OCelot tat, der jedoch die Kontrolle über Metal Gear RAY übernahm. Sie starteten einen Kampf zwischen Mechs, der damit endete, dass beide schwere Veletzungen erlitten.

Liquid Ocelot springt an Bord von Outer Haven. Kurz darauf folgt Snake ihm, zusammen mit Raiden und der Rat Patrol Unit an Bord.

Nachdem Snake das mikrowellen Verteidigungssystem von Outer Heaven durchbrach, gelingt es ihm die Railgun zu stoppen indem er FOXALIVE, ein Virus von Naomi HUnter und Sunny hergestellt , benutzte. Das Virus zerstörte das Patroit System, welches damit schlussfolgert, dass alle nanomschinen sowie KIs der Patriots zerstört werden. Die Welt ist jetzt frei von den Patriots.

Liquid Ocelot enthüllt das FOXALIVE, sein Weg den Traum von Big Boss zu erfüllen, von Anfang an sein Plan war. Liquid Ocelot und Snake treffen in einem finalen Duell aufeinander, bei dem Liquid Ocelot stirbt.

Snake besucht das Grab von Big Boss. Mit nur noch einem Jahr zu leben, dem FOXDIE mutieren und drohen, jeden in seinem Umfeld zu töten, beschließt er Selbstmord zu begehen.

Bevor er den Abzug drücken kann nähert ihm sich ein Mann, der einen anderen Mann im Rohlstuhl schiebt. Dieser Mann ist Big Boss, der den nun gelähmten Major Zero vor sich her schiebt.

Big Boss erklärt, dass der gefrorene Körper welcher von Liquid Snake benutzt wurde, der von Solidus Snake war und es nur funktionierte, weil er sein perfekter Klon war.

Big Boss erklärt, dass Major Zero zuließ das die KI die Kontrolle über die Patriots übernimmt. Dies führte dazu, das die Welt auf die Kriegswirtschaft angewiesen war.

Big Boss ist sich bewusst das seine Vision der Welt sehr stark von der von The Boss abgewichen ist und dreht schließlich die Sauerstoffzufuhr, die Major Zero am leben hält, zu.

Snake und Big Boss versöhnen sich, wonach Big Boss in Snakes Armen stirbt.

Raiden tritt einer privaten Sicherheits-Organisation namens Maverick bei. Ihr Ziel ist das beschützen der Schwachen und jener die militärische Unterstützung benötigen.

Währenddessen versucht der Premierminister in Afrika sein Land wieder aufzubauen, welche große Verluste während des Bürgerkrieges einstecken musste. Eines Tages, wird er von einem privaten Militärunternehmen namens Desperado angegriffen und als Geisel genommen.

Raiden folgt den Entführern, jedoch wird der Premierminister getötet. Raiden kämpft gegen Sam Rodriguez, einem stärkeren cyborg ninja. Raiden wird besiegt und verliert ein Auge und einen Arm.

Maverick wird aufgetragen in Abkhazia einzugreifen, wo eine Gruppe versucht die Regierung zu stürzen. Maverick sendet Raiden, welcher sich jetzt vom Kampf erholt hat, um den Anführer der Gruppe, Andrey Dolzaev, zu fangen.

Raiden findet Beweise dass Desperado, die PMC die den Premierminister angegriffen hat, ebenfalls eine Gruppe in Abkhazia unterstützt und einen Angriff plant.

Raiden wird nach Mexiko geschickt, wo Desperado ein kybernetisches Labor besitzt. Schnell lässt sich feststellen, dass Kinder in diesem Labor festgehallten werden. Die Gehirne der Kinder werden dort entfernt und virtuell trainiert, mit dem Ziel zum Cyborgsoldaten ausgebildet zu werden, welche für World Marshal, ein amerikanischen PMC, kämpft.

Maverick ist es nicht gestattet World Marshal anzugreifen, woraufhin Raiden, wütend von dem was sie den Kindern angetan hatten, die Mission abbricht und auf eigene Faust nach World Marshals Hauptquartier sucht.

Raiden erreicht das Hauptquartier und besiegt Sundowner, Kopf der PMC, welcher den afrikanischen Premierminister tötete. Raiden versteht jetzt, dass die Attacke auf den US Präsidenten Hemilton gerichtet ist, welcher jetzt auf Visite in Pakistan ist. Dies wird Raidens nächstes Ziel.

Wegen einer feindlicher Attacke, ist Raiden gezwungen den Helikopter zu verlassen. Er muss jetzt Solis finden, eine private Weltraumflug Organisation, welche ihm ermöglichen kann schnell genug nach Pakistan zu fliegen, bevor die Attacke ausgeführt wird.

Raiden trifft erneut auf Sam Rodriguez. Sie kämpfen, wobei diesmal Raiden gewinnt.

Raiden erreicht schließlich Solis, wo Sunny derzeit arbeitet. Der Abschuss ist ein Erfolg und Raiden landet in Pakistan.

Raiden entdeckt, dass Steven Armstrong der Senator von Colorado hinter dem Attentat steckt. Armstrong, in Besitz eines neuen Metal Gear namens EXCELSUS, möchte ein Krieg zwischen den Vereinigten Staaten und Pakistan auslösen, damit die Militärwirtschaft erneuern und so neuer Präsident werden.

Raiden zerstört zunächst Metal Gear EXCELSUS, wonach er mit Armstrong kämpft und ihn besiegt.

Krieg wurde verhindert, doch die Spannungen zwischen den Vereinigten Staaten und Pakistan sind immernoch stark.

Maverick wird durch nutzung der Gehirne, um Arbeiter und Krankenschwestern zu produzieren, zur führenden Firma für Kybernetik.

Raiden beschließt, unabhängig gegen die korrupten PMC zu kämpfen.

The end

About the project

I'm Alex, game designer and huge Metal Gear fanboy.

Every time a new Metal Gear is about to be released, I have to reorganize all my thoughts and memories, which is usually a tiring task. I started looking for accessible ways to have an overview of the different game events, but I figured out that there was no such a thing available.

I therefore decided to spend some of my spare time creating the Metal Gear Timeline: I hope you will like it and find it useful (whether you love or hate this crazy saga).

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