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Os Filósofos, uma organização que visa o controle total (economia, política, poder), é criada pelas forças unidas da Rússia, China e EUA. Não se sabe quem os Filósofos são.

Durante a 2ª Guerra Mundial, os Filósofos fazem um pacto que culmina na criação do Legado dos Filósofos. O Legado contém cem bilhões de dólares, e os nomes dos membros secretos da organização.

Após a 2ª Guerra Mundial, o dinheiro do Legado dos Filósofos foi roubado, escondido e espalhado por vários bancos. Os registros das transações foram guardados num microfilme. Quem tiver controle do microfilme ganha acesso ao Legado. Obviamente, Rússia, China e os EUA estão à procura do Legado para obter poder absoluto.

Após o mandato de Stalin, a Rússia é liderada por Nikita Khrushchev.

O cientista nuclear Nikolai Sokolov começa a trabalhar numa nova arma nuclear russa: o Shagohod.

Descobre-se que a Rússia está enviando mísseis balísticos de alcance intermediário para Cuba, um de seus países aliados. Isto é extremamente preocupante para os EUA, já que a Rússia supostamente poderia atacá-los caso as armas nucleares cheguem em Cuba.

Enquanto isso, Nikolai Sokolov começa a temer sua própria criação, o Shagohod, e decide desertar para os EUA. Ele escapa da Rússia com sua família, mas é reconhecido e detido em Berlim.

Presidente Kennedy exige que a Rússia desmantele as armas nucleares, mas a Rússia se nega. Os EUA e a Rússia entram em alerta para uma guerra nuclear. Eventualmente, a Rússia decide destruir suas armas mas, em troca, requer Sokolov de volta ao país. Sokolov é enviado para a Rússia para continuar seu trabalho no Shagohod.

A CIA cria a Unidade FOX (Force Operation X), um grupo usado para executar operações secretas especiais. FOX é comandada por um homem chamado de Major Zero.

A fim de fornecer suporte tático a FOX, Major Zero criou o grupo militar secreto XOF e elegeu um homem chamado Skull Face como seu lider.

Os EUA enviam The Boss, sua melhor agente, para a Rússia numa tentativa de encontrar o Legado dos Filósofos.

FOX envia seu agente secreto Naked Snake para a Rússia, para encontrar e recuperar Sokolov, e destruir o Shagohod. A missão é chamada de Virtuous Mission. Durante a missão, Naked Snake é auxiliado via rádio por outros membros da FOX: Major Zero, Sigint e Para-Medic.

Perto de completar sua missão, Naked Snake é parado por sua mentora, The Boss. Aparentemente, The Boss desertou para a Rússia, tornando-se uma traidora aos EUA.

Rússia é representada militarmente pela Spetsnaz GRU, sua força militar. Um grupo rebelde da Spetsnaz GRU, liderado pelo Coronel Volgin, pretende se opor ao primeiro-ministro soviético Nikita Khrushchev.

The Boss dá à Rússia uma ogiva nuclear americana, usada pelo Coronel Volgin para destruir um centro de pesquisa russo. Dessa forma, soa como um ataque dos EUA contra a Rússia, um plano brilhante orquestrado pelo país.

O presidente da Rússia Khrushchev exige agora que os EUA provem que não estão envolvidos no ataque nuclear planejado por The Boss e Volgin. Eles portanto decidem enviar Naked Snake de volta à Rússia com o objetivo de cumprir o pedido de Khrushchev: se livrar de The Boss, mentora de Naked Snake, e Coronel Volgin. Operação Snake Eater.

Major Zero designa secretamente Skull Face, lider da XOF, para assistir a Naked Snake durante a missão, mas ninguém sabe sobre o envolvimento de Skull Face nesses eventos.

A KGB coloca a Unidade FOX em contato com dois agentes da NSA, que desertaram para a Rússia em 1960: ADAM e EVA. ADAM ajudará Naked Snake a obter informações e eventualmente escapar.

No ponto de encontro, apenas EVA aparece, dizendo que foi enviada no lugar de ADAM. Naked Snake e EVA são atacadas por uma unidade militar liderada por Ocelot. Ocelot toma EVA como refém, mas é derrotado e forçado a bater em retirada.

Naked Snake e EVA descobrem que Volgin possui o Legado dos Filósofos.

Em sua missão para achar o Shagohod, Naked Snake encontra e derrota todos os membros da Unidade Cobra excluindo The Boss: The Pain, The Fury, The End, The Fear e The Sorrow. Durante um interrogatório realizado por Volgin, The Boss e Ocelot, Naked Snake é atingido por uma bala e perde um de seus olhos.

Naked Snake destrói o Shagohod e mata o Coronel Volgin.

O que Naked Snake não sabe, entretanto, é que EVA é na verdade uma espiã do governo chinês (pois a China também quer colocar suas mãos no Legado dos Filósofos). EVA consegue obter o microfilme, mas é revelado depois que esse microfilme era uma falsificação. Quem tomou posse do verdadeiro foi Ocelot, um agente triplo que trabalha para os Filósofos. Ocelot era de fato ADAM, mas ninguém sabia disto.

Ocelot dá o Legado para os EUA, mas somente metade é recuperada. Assume-se que a outra metade está nas mãos da KGB.

Naked Snake descobre que The Boss não desertou dos EUA; pelo contrário, estava seguindo suas ordens o tempo inteiro. Ela foi ordenada pelo Governo a ganhar a confiança de Volgin ao dar-lhe a ogiva nuclear, e seu objetivo era - é claro - ganhar acesso ao Legado. O que eles não esperavam era que Volgin fosse realmente usar a ogiva nuclear no centro de pesquisa russo para incriminar os EUA. Neste instante a missão de The Boss foi alterada. Ela então deveria continuar agindo sob seu papel e esperar para ser morta por Naked Snake, de forma a salvar os EUA da acusação. Ela foi um herói de seu país, e para sempre lembrada como uma traidora.

Os EUA premiam Naked Snake com o novo título de Big Boss.

Forçado a viver nas sombras, Skull Face nutre um ódio, tanto pelo Major Zero quanto por Naked Snake.

Ocelot fala ao telefone com o diretor-chefe da KGB, discutindo o papel de Nikita Khrushchev. Logo após, Khrushchev é retirado do cargo.

Enfurecido pelo o que o governo fez a ele e The Boss, Big Boss sai da FOX, seguido pouco tempo depois por Major Zero, o chefe do grupo militar.

Gene se junta à Unidade FOX, e torna-se seu líder sob o condinome Viper.

Durante a Guerra de Independência de Moçambique, Big Boss - agora um mercenário - conhece Frank Jaeger, um soldado muito jovem. Ele o coloca num centro de reabilitação acreditando que ali estaria a salvo.

No centro de reabilitação, Frank Jaeger é capturado pela CIA e usado como cobaia para a criação de um super soldado. Ele sofre uma lavagem cerebral e recebe o condinome Null.

Gene transforma FOX em um grupo rebelde, rompendo sua aliança com a CIA. A Unidade FOX agora busca a outra metade do Legado dos Filósofos.

Big Boss é preso por Gene. Na prisão, Big Boss torna-se amigo de Roy Campbell.

Big Boss consegue escapar, mas o governo americano o acusa junto do Major Zero de transformar FOX num grupo rebelde.

Big Boss e Roy Campbell - junto de Major Zero, Para-Medic e Sigint- criam a organização independente FOXHOUND com o objetivo de limpar seus nomes e eliminar os membros restante da FOX.

Big Boss encontra Null - agora um dos membros da Unidade FOX - mas não o reconhece. Eles lutam, e Big Boss é capturado.

Durante a missão, Big Boss recebe uma informação de que a FOX possui um Metal Gear chamado RAXA.

Big Boss encontra e destrói o Metal Gear RAXA, que depois é revelado ser apenas um modelo de teste.

A caminho de destruir o verdadeiro Metal Gear, Big Boss encontra novamente Null. Big Boss o reconhece como Frank Jaeger, mas Null não acredita em seus relatos. Após a luta, Null é derrotado e acredita em Big Boss. Ele agora lembra de sua identidade como Frank Jaeger.

Big Boss derrota Gene, que lhe dá todas as posses da Unidade FOX. Essas incluem dinheiro, soldados, e os planos de construir numa nova nação militar.

Big Boss impede o ataque nuclear planejado pelo verdadeiro Metal Gear. A missão é oficialmente completada.

Enquanto isso, Ocelot planeja controlar as duas metades do Legado dos Filósofos. Ele mata o chefe da CIA, e obtém a segunda metade do Legado, junto da lista dos nomes dos Filósofos.

Big Boss regressa à FOX, junto do Major Zero, Para-Medic e Sigint.

Major Zero, Ocelot e Big Boss usam o Legado para reorganizar os Filósofos. Eles formam os Patriotas, e tornam Big Boss o rosto da organização.

O objetivo dos Patriotas é realizar o sonho de The Boss de criar um mundo unificado.

Major Zero começa a espalhar histórias sobre Big Boss, algumas verdadeiras, outras falsas. Isso cria tensão entre os dois homens.

A Nação Navajo nos EUA é rica em minério de urânio, que pode ser usado para armamento nuclear. Code Talker, nativo Navajo, começa a pesquisar micróbios com a capacidade de desativar urânio.

Code Talker também estuda o corpo do membro da Unidade Cobra, The End, e descobre os parasitas que elevaram suas habilidades. Esse parasita existe em diversas formas, uma delas sendo um parasita de cordas vocais, onde é capaz de infectar uma pessoa falando uma lingua especifica. Os Filósofos tentaram replicar esses parasitas, mas eventualmente abandonaram o projeto.

Durante a Guerra Fria, uma mulher soviética morreu ao dar luz à seu filho. Um dia essa criança, chamada Tretij Rebenok - descobriu seu poder psíquico após conseguir ler a mente de seu pai. Ele descobriu que seu pai o odiava e enfurecido, o garoto mata seu pai queimando sua vila inteira.

O antigo líder da União Soviética, Nikita Khrushchev, morre de um ataque cardíaco.

Major Zero começa, em segredo, um projeto chamado Les Enfants Terribles com o objetivo de criar clones do maior soldado que já existiu, Big Boss. Para isso, ele usa EVA como uma mãe de aluguel.

Nascem os irmãos gêmeos Liquid Snake e Solid Snake. Eles são considerados clones imperfeitos. Um terceiro clone, perfeito, é produzido: Solidus Snake.

Todos os clones receberam genes de envelhecimento acelerado, a fim de evitar que fossem usados ou se revoltassem contra os Patriotas.

Big Boss finalmente descobre sobre este projeto, o que causa sua indignação total. Big Boss acredita que Major Zero e os Patriotas interpretaram errado o ideal original e belo de The Boss.

Big Boss deixa os Patriotas. Major Zero renomeia a si e sua organização como Cipher.

Big Boss cria seu próprio grupo militar mercenário, chamado Militaires Sans Frontières. Seu objetivo é fornecer força militar a todos que precisem, independente de nações ou ideologias.

Vem à tona que a Costa Rica está sendo oprimida por uma força militar desconhecida, possivelmente em posse de ogivas nucleares.

Big Boss e MSF são convidados pelas forças armadas da Costa Rica, representadas por Galvez e Paz, a intervir e acabar com esta força militar. Eles oferecem a Big Boss uma planta de operação no Mar do Caribe, chamada Mother Base.

Big Boss aceita e vai para Costa Rica, auxiliado via rádio por Kaz Miller, subcomandante da MSF. Big Boss obtém a confirmação acerca da existência de ogivas nucleares.

Big Boss encontra Amanda, líder da resistência em Costa Rica. Ela confirma que as forças da oposição são apoiadas pela CIA. Seu irmão, Chico, é sequestrado por um drone. Big Boss a convence a ingressar na MSF e parte em uma missão para resgatar Chico e localizar as ogivas nucleares.

Big Boss resgata Chico, que também ingressa na MSF. Big Boss prossegue com a missão para encontrar a ogiva nuclear. Descobre-se que Hot Coldman, um agente da CIA, quer usar o Metal Gear - criado pelo cientista Huey Emmerich - para lançar uma ogiva e testar sua eficácia.

Coldman ataca Huey Emmerich, que mais tarde ajuda Big Boss. Emmerich revela o plano de Coldman. Seu exército possui um novo Metal Gear chamado Peace Walker, capaz de selecionar alvos adequados para ataques nucleares sem a necessidade de envolvimento humano. A IA deste Metal Gear - desenvolvido pelo Dr. Strangelove - é construída com base nos traços da personalidade de The Boss.

Big Boss precisa parar Hot Coldman. Huey Emmerich junta-se à MSF.

Hot Coldman tenta alterar a IA do Peace Walker para fazê-lo atacar a MSF.

É revelado que Galvez (cujo nome verdadeiro é Zadornov) sempre trabalhou com Coldman, mas agora pretende traí-lo. Zadornov pretende usar o Peace Walker para atacar Cuba (aliada da Rússia) a partir de uma base norte-americana. Isto incriminará os EUA e dividirá o norte e o sul, dando uma grande vantagem à Rússia.

Zadornov atira em Hot Coldman e o obriga a reprogramar a IA para atacar Cuba. Na verdade, ele a reprograma para fingir um sinal de ataque nuclear a Cuba, fazendo com que pareça um ataque conduzido pela Rússia.

Os EUA estão prontos para contra-atacar com seu poderio nuclear.

O Peace Walker, impulsionado pelo desejo da IA de The Boss, se sacrifica ao se afogar em um lago, destruindo o sinal falso e evitando uma guerra nuclear.

Após concluir a missão, Big Boss, com a ajuda de Miller e do cientista Huey Emmerich e Dr.ª Strangelove, voltam para Mother Base e começam a trabalhar no seu próprio Metal Gear, chamado ZEKE.

Paz rouba e toma controle do Metal Gear Zeke, afirmando que o está levando de volta para seu verdadeiro líder, Cipher. Ela acusa Big Boss de ter escolhido o caminho errado, desde que se afastou de seu antigo comandante da FOX, Major Zero, dois anos atrás.

Paz pede a Big Boss que se junte a eles, mas ele recusa. Paz planeja usar o Metal Gear para lançar armas nucleares nos EUA e incriminar Big Boss e MSF pelo ataque. Uma luta começa, e eventualmente Big Boss destrói o Metal Gear ZEKE. Paz é atingida pela explosão e supostamente morta.

Dra. Strangelove deixa a Militaires Sans Frontieres pois sua pesquisa de desenvolvimento de IA não é mais necessária.

Miller revela a Big Boss que Cipher é Major Zero.

Big Boss diz a suas tropas que eles servirão sob qualquer um, não importam nações ou ideologias, e que em breve construiriam uma nação a qual poderiam chamar de sua, Outer Heaven.

Foi revelado que todos esses eventos foram orquestrados por Cipher, que sabia que Big Boss era o único capaz de construir a Mother Base e crescer como força militar. Seu objetivo era eventualmente tomar controle da Mother Base - por isso Paz tenta convencer a Big Boss juntar-se a Cipher.

Skull Face, o lider da XOF, encontra Code Talker, que está precisando de financiamento para sua pesquisa de micróbios. Skull Face - sem a permisão de Major Zero - financia a pesquisa de Code Talker, mas o força a estudar o potencial dos micróbios para desenvolvimento nuclear. A pesquisa leva a criação de diferentes micróbios (Também chamados de "Archaea") que contém várias propriedades de aprimoramento, úteis para propósitos militares.

A Agência Internacional de Energia Atômica envia uma carta para MSF exigindo uma inspeção na Mother Base. Big Boss e Kaz Miller acham que esta inspeção é na verdade orquestrada por Cipher para localizar a ogiva nuclear do Metal Gear Zeke, como vingança pelo o que aconteceu no ano anterior.

Big Boss e Miller descobrem que Paz sobreviveu à explosão, e buscam sequestrá-la para obterem informações sobre a natureza de Cipher. Eles mandam Chico numa expedição para encontrar sua irmã, mas ele foge e tenta resgatar Paz sozinho. Logo, é feito prisioneiro e preso em correntes com Paz, no Acampamento Omega.

Chico sofre terríveis torturas por Skull Face, o líder da XOF. Chico acaba dando a Skull Face todas as informações sobre MSF e Mother Base, confirmando a localização do Metal Gear ZEKE. Skull Face faz Chico enviar um SOS para Mother Base.

Skull Face revela que Paz é a única agente da Cipher que se encontrou com Zero cara a cara, e por isso decide torturá-la para encontrar sua posição. Seu objetivo é se livrar da Cipher. Ele insere duas bombas no corpo de Paz, antecipando a possibilidade de uma tentativa de resgate.

Big Boss e Miller sabem que o SOS pode ser uma armadilha, mas mesmo assim decidem começar uma missão de resgate.

Big Boss encontra Chico em estado de pânico. Para evitar chamar atenção desnecessária, Big Boss nocauteia Chico e chama um helicóptero para enviá-lo de volta à Mother Base.

Big Boss procede com sua missão e acaba encontrando e resgatando Paz, a trazendo no helicóptero. Nele, Big Boss descobre que Paz possui uma bomba em seu corpo e graças à ajuda de um médico a extrai dela.

Quando se aproximam de Mother Base, descobrem que ela está sob ataque da XOF. Mother Base rui, e parece que somente Big Boss, Miller e um soldado sobrevivem ao acidente.

No helicóptero, Paz revela que ela possui outro explosivo em seu corpo ao pular do helicóptero e explodir. O helicóptero da MSF colide com um outro, da XOF, o que resulta em Big Boss entrando num coma.

Todos acham que não existem sobreviventes. Major Zero contacta EVA e pede para que traga Big Boss, Miller e o médico para um hospital em Cyprus.

Aparentemente Huey Emmerich permitiu que a XOF organizasse esse ataque. Huey é eventuamente sequestrado por Skull Face, forçado a juntar-se a XOF e a trabalhar em seu novo Metal Gear.

Enquanto isso, Dra. Strangelove recupera a IA de Peace Walker e começa a trabalhar, a mando de Major Zero, na rede de IA que planeja construir.

Skull Face, que forçou Paz a revelar a localização de Major Zero, envia um pacote contendo um pino que pertenceu a The Boss, porém, infectado com o parasita. Major Zero, que acidentalmente foi picado por um alfinete, fica infectado. Esta é a vingança pessoal de Skull Face contra Major Zero, por sempre o ter comandado.

A partir desse momento, Ocelot cuida de Big Boss e do médico, ambos em coma após a colisão do avião.

Liquid Snake é abandonado por Cipher e enviado para Inglaterra.

Não há rastros de Major Zero.

Durante a Guerra Civil da Rodésia, Frank Jaeger mata um jovem casal. Descobrindo que eles possuíam uma filha, e sentindo remorso, ele decide tomar conta dela como uma irmã, e a nomeia Naomi Hunter. Ela nunca saberá que Frank Jaeger matou seus pais.

A União Soviética invade o Afeganistão. Miller - financiado pelos EUA - treina a resistência Afegã. Após o incidente da Mother Base, Miller perdeu uma perna e um braço.

Durante a guerra entre as duas facções, soldados Soviéticos descobriram o poder brutal de Quiet, uma assassina posteriormente contratada pela XOF.

Huey Emmerich, agora trabalhando para XOF, casa-se com a Dra. Strangelove. Eles têm um filho e o chamam de Hal. Huey usa Hal como cobaia para testar a IA do novo Metal Gear Sahelanthropus. O resultado é a luta entre ele e sua esposa Dra. Strangelove, que eventualmente termina sendo presa na capsula da IA e morre sufocada.

Tretij Rebenok, criança psiquica nasceu na década de 70, foi capturada pelas Forças Soviéticas e levado a um laboratório onde pesquisam indivíduos com habilidades paranormais. Na mesma instalação estão estudando o corpo em coma do Coronel Volgin, cujo o desejo de vingança contra Big Boss o manteve vivo. A presença de Tretij o despertou totalmente, transformando-o no Man of Fire.

Big Boss desperta do coma e descobre que tem um braço protético e um fragmento de metal em sua cabeça.

XOF acaba descobrindo que Big Boss é mantido no hospital em Chipre. Seu objetivo é eliminar Big Boss e cada traço de seu envolvimento. Eles enviam Quiet para livrar-se de Big Boss.

Enquanto Quiet tenta estrangular Big Boss, é interrompida por outro paciente chamado Ishmael, que, eventualmente, a põe fogo. Quiet envolta em chamas, caiu pela janela.

Big Boss, com a ajuda de Ismael, tenta escapar do hospital. A chegada inesperada de Tretij e Man on Fire - que querem Big Boss morto - acidentalmente sabotam a missão da XOF.

XOF falha em sua missão, mas consegue esconder o seu envolvimento nos eventos. Big Boss - agora também conhecido como Venom Snake - consegue escapar graças à ajuda de Ocelot, que o envia para o Afeganistão. Sua missão é reconstruir a Mother Base, liderando o seu novo grupo militar chamado Diamond Dogs.

Quiet passa por um tratamento médico com parasitas que a mantem viva e permite que desenvolva a capacidade de respirar através de sua pele.

Venom Snake encontra e resgata Miller, que estava mantido em cativeiro em um posto Soviético.

Venom Snake é enviado em missão para encontrar Quiet. Após derrotá-la, a captura e a traz para Mother Base, onde é mantida como prisioneira.

Venom Snake encontra e resgata Huey Emmerich, mas são atacados pelo Metal Gear Sahelanthropus, que está sendo controlado por Tretij. Venom Snake destrói partes do Metal Gear e consegue recuar para Mother Base.

Enquanto isso, Quiet começa a ajudar Venom Snake durante várias missões, assim, começando a criar um vínculo.

Venom Snake, na tentativa de encontrar o Líder de um grupo de crianças soldado, acaba em um local onde estão conduzindo experimentos humanos. Depois de um rápido encontro com Skull Face, Venom Snake é atacado por Man on Fire e Tretij, mas consegue fugir.

Venom Snake encontra Liquid Snake (conhecido como Eli), agora líder de um grupo de crianças soldado. Eli é trazido para Mother Base e com raiva de seu pai, tenta matá-lo, mas sem sucesso.

Venom Snake e Ocelot fazem testes de DNA para saber se Eli é seu filho. Os testes são negativos.

Uma terrível epidemia se espalha pela Mother Base, levando muitos membros da equipa a morte. Para encontrar a cura, Venom Snake vai em uma missão a procura de Code Talker, que tem sido usado por Skull Face para o desenvolvimento do parasita de cordas vocais. Ao que parece, o parasita infecta somente hospedeiros adultos que falam uma determinada língua.

Venom Snake encontra e resgata Code Talker, que lhe dá a bactéria Wolbachia, a cura para epidemia. Code Talker acredita que a intenção de Skull Face é utilizar o parasita como um purificador étnico, erradicando todos idiomas, exceto o Inglês.

Skull Face revela que seu plano é seguir a visão de mundo de The Boss e quer a atingir silenciando o mundo. Ele realmente quer usar o parasita de cordas vocais para infectar todos quem falam Inglês no mundo.

Tretji controla mentalmente Eli, a fim de conseguir se vingar de Venom Snake. Eli consegue o controle de Sahelantropus e ataca os soldados de Skull Face, além de Venom Snake, que eventualmente consegue incapacitar o Metal Gear

Venom Snake e Miller encontram Skull Face sob os destroços. E então eles se vingam pelo o que foi feito contra os MSF e a Base-Mãe, atirando em Skull Face com a sua própria arma, desmembrando a sua perna esquerda e seu braço direito. Huey Emmerich finaliza atirando na cabeça.

Venom Snake encontra e destrói os frascos com os parasitas das cordas vocais da Língua Inglesa, que Skull Face possuía. Ninguém percebe, no entanto, que Treji consegue salvar uma amostra desses parasitas.

Venom Snake, Miller e Huey voltam para a Base-Mãe, levando com eles o Metal Gear Sahelanthropus. Tretji, discretamente entrega o frasco contendo os parasitas da corda vocal Inglesa, para Eli.

Outra infecção se espalha pela Base-Mãe, na plataforma de Quarentena. Mais tarde é sabido que Huey, acidentalmente, acionou os parasitas Wolbachia ao usar radiação beta neles. No intuito de impedir uma pandemia, Venom Snake se vê obrigado a matar todos os soldados da Diamond Dogs que estavam na plataforma de Quarentena.

Descobre-se que Huey estava em contato com a DARPA (interligada à CIPHER), e oferece dos amostras dos parasitas em troca de resgate. Huey Emmerich é expulso da Base-Mãe.

Quiet é capturada pelas forças soviéticas. Venom Snake a localiza e a resgata. Após uma tempestade de areia ela desaparece de novo, deixando para trás uma fita cassete para Venom Snake. Na fita, ela revela que nunca disse uma palavra porque estava infectada com o parasita da corda vocal Inglesa, mas jamais cogitou usá-lo contra Venom Snake ou nos Diamond Dogs.

Venom Snake recebe uma fita cassete que revela a sua verdadeira identidade e seu propósito. Venom Snake era o melhor soldado que a MSF já teve. Ele era o médico que entrou em coma junto com Big Boss. Sob as ordens do Major Zero, os médicos realizaram uma cirurgia para deixá-lo igual ao Big Boss, permitindo assim que o verdadeiro Big Boss pudesse se manter fora do radar, para que esse conseguisse fundar as intalações do que viria a ser Outer Heaven. O verdadeiro Big Boss na verdade era Ishmael, o paciente que ajudou Venom Snake a escapar do hospital.

Big Boss pediu à Ocelot que cuidasse de Venom Snake e colaborasse com o seu grande plano. Com o uso de terapia hipnótica, Venom Snake foi levado a crer que ele era de fato o verdadeiro Big Boss, e como era extremamente habilidoso, todos ao redor também acreditaram.

Eli escapa da Base-Mãe, juntamente com outras crianças-soldados que foram resgatadas pelos Diamond Dogs. Graçãs a ajuda de Tretji, ele rouba o Sahelanthropus e se retira para uma ilha africana. A ilha está completamente infectada por parasitas, porém as crianças não são afetadas, somente adultos.

Venom Snake se infiltra na ilha, a qual já está infestada de soldados da CIPHER, que estavam tentando reaver o Metal Gear. Eli ativa Sahelanthropus e ataca Venom Snake, que o destrói novamente.

Soldados da Diamond Dogs chegam ao local para evacuar Venom Snake, já que a ilha está totalmente infectada por parasitas e Eli também está infectado.

Tretji reaparece e, com os seus poderes sobrenaturais, remove o parasita do corpo de Eli. Eles sobrevoam para fora da ilha, enquanto os Diamond Dogs jogam bombas de napalm na ilha, para evitar outro surto de parasitas.

Solid Snake, enviado pelos EUA, luta na Guerra do Golfo.

Big Boss está (novamente) no comando da FOXHOUND, mas o governo norte-americano não sabe disso. Os EUA também não sabem que Big Boss é o líder de Outer Heaven ao mesmo tempo.

Outer Heaven cria o TX-55 Metal Gear para conseguir lutar com Major Zero e seu grupo, os Patriotas.

Fim da União Soviética.

O coronel da GRU Sergei Gurlukovich, um amigo de Ocelot durante a Guerra Fria, forma o grupo militar chamado Mercenários Gurlukovich, com o objetivo de restaurar Rússia à sua antiga glória.

Os EUA descobrem que Outer Heaven está construindo seu próprio Metal Gear, e decide enviar FOXHOUND para destruí-lo. Big Boss, no entanto, está no controle de ambas Outer Heaven e FOXHOUND.

Como chefe da FOXHOUND, Big Boss envia Frank Jaeger para investigar Outer Heaven.

Jaeger, sob o condinome Gray Fox, falha e é capturado.

Big Boss envia Solid Snake - um dos melhores agentes americanos - para resgatar Gray Fox.

Solid Snake salva Gray Fox e procede com sua missão de destruir o Metal Gear.

Big Boss revela então que ele comanda Outer Heaven, e tenta parar Solid Snake. Big Boss revela que ele retomou controle da FOXHOUND para retardar a missão de Solid e terminar a construção do Metal Gear.

Solid Snake destrói o Metal Gear e toda a base. Enquanto todos estão convencidos de que ele está morto, Big Boss sobrevive à explosão e foge para o Oriente Médio com todos seus soldados.

Roy Campbell substitui Big Boss no comando da FOXHOUND.

Big Boss ajuda Zanzibar a se tornar independente da Rússia.

O mundo está sofrendo uma grande crise pela escassez de petróleo. Para resolver o problema, Doutor Kio Marv cria um óleo sintético.

Dr. Kio Marv é sequestrado pelos soldados em Zanzibar, que querem manter o mundo refém ao ganhar controle do óleo sintético. Para impedir que Dr. Kio escape ou seja resgatado, Zanzibar faz uso dos Metal Gears em seu território.

Roy Campbell, agora chefe da FOXHOUND, envia Solid Snake numa nova missão, agora para resgatar Dr. Kio Marv.

Solid Snake descobre que Big Boss sobreviveu após os eventos de 1995, e que Dr. Kio Marv está morto. Por outro lado, ele encontra a fórmula do óleo sintético.

Solid Snake é atacado por Gray Fox, que está pilotando o Metal Gear D. Solid Snake destrói o Metal Gear e começa uma luta com Gray Fox em um campo minado.

Solid Snake mata Gray Fox, e posteriormente atacado por Big Boss. Mais uma vez, Solid Snake vence a luta.

Logo antes de morrer, Big Boss revela a Solid Snake que é seu pai.

Os Patriotas recuperam o corpo de Big Boss. Major Zero o coloca em um coma criogênico graças ao uso de nanomáquinas. Seu objetivo é usar os genes de Big Boss para melhorar o desempenho e as habilidades de todo soldado.

Ocelot, por não concordar com este plano, começa a conspirar contra Major Zero e os Patriotas.

Roy Campbell deixa FOXHOUND.

Liquid Snake se junta a FOXHOUND e logo toma seu controle.

Major Zero, ficando velho, começa a ficar desconfiado de todos, e não quer que ninguém tome controle dos Patriotas.

Major Zero comissiona a criação de uma IA avançada (chamada de The System) para controlar os Patriotas. The System consiste em quatro IAs diferentes controladas por uma quinta, mestre de todas.

Solidus Snake orquestra o futuro incidente em Shadow Moses.

Dra. Naomi Hunter cria FOXDIE, um vírus capaz de matar uma pessoa específica baseado em seu DNA e nanomáquinas. Seu plano original é usar o vírus para matar Solid Snake, que matou Gray Fox (Frank Jaeger, que a adotou e tomou conta dela desde 1979).

FOXHOUND, agora guiada por Liquid Snake, lidera uma revolta militar na ilha de Shadow Moses, em Alaska. Eles possuem o Metal Gear REX e estão ameaçando os EUA com um bombardeio nuclear caso não os dêem o corpo de Big Boss e um bilhão de dólares dentro de 24 horas.

Roy Campbell, longe da FOXHOUND desde 2000, envia Solid Snake, com a missão de encontrar dois reféns: o chefe da DARPA e o presidente da ArmsTech. Eles poderão confirmar se Liquid Snake é realmente capaz de lançar um ataque nuclear.

Solid Snake encontra o chefe da DARPA, que morre de um ataque cardíaco imediatamente após.

Solid Snake encontra o presidente da ArmsTech, que está sendo mantido refém por Ocelot - agora no lado de Liquid Snake. Ocelot desafia Solid Snake um duelo de armas. Ao final da luta, um Ninja Ciborgue aparece e corta o braço de Ocelot.

Durante a primeira parte da missão, Solid Snake resgata Meryl Silverburgh (filha de Roy Campbell) e o cientista Hal Emmerich (filho de Huey Emmerich, o cientista que ajudou Big Boss na construção do Metal Gear ZEKE em 1974).

Hal Emmerich, também conhecido como Otacon, está construindo o Metal Gear REX, alheio ao fato de que esse possui uma ogiva nuclear. Após descobrir isso, ele decide se juntar à causa de Solid Snake.

Solid Snake encontra novamente o Ninja Ciborgue e após uma intensa luta ele descobre sua identidade verdadeira: Gray Fox - Frank Jaeger.

Solid Snake começa a entender uma nova parte do plano de Liquid Snake: ele quer se juntar às forças mercenárias de Sergei Gurlukovich e transformar Shadow Moses em uma nova Outer Heaven, seguindo o sonho de Big Boss de um mundo com soldados livres.

Solid Snake eventualmente encotnra o Metal Gear REX sendo pilotado por Liquid Snake. Gray Fox intervém mais uma vez ao destruir parte do Metal Gear REX, na tentativa de ajudar Solid Snake. Gray Fox é morto esmagado por Liquid Snake.

Solid Snake destrói o Metal Gear REX e entra em combate corpo-a-corpo com Liquid Snake. Liquid Snake decide fugir, mas durante a fuga no jipe morre de um ataque cardíaco.

Solid Snake, discutindo com Naomi Hunter, descobre que ela o infectou com o FOXDIE no início da missão, pois não sabia que Frank Jaeger ainda estava vivo. Ela diz a Solid Snake que ele deve ter apenas alguns anos para viver.

Após os eventos de Shadow Moses, Revolver Ocelot - o único membro sobrevivente da FOXHOUND - relata os eventos ao presidente dos Estados Unidos, revelando que estava operando como um agente duplo para recuperar informações do REX para os EUA.

Revolver Ocelot revela a identidade do presidente dos EUA: o terceiro clone de Big Boss, Solidus Snake. Solidus Snake foi feito presidente dos EUA pelos Patriotas em 2001 sem que ninguém soubesse de sua identidade verdadeira.

Nastasha Romanenko, que ajudou Solid Snake em sua missão, publica o livro chamado « In the Darkness of Shadow Moses : The Unofficial Truth », onde revela todos os eventos do incidente em Shadow Moses, incluindo o envolvimento de Solidus Snake.

Solidus Snake é forçado a se retirar do seu cargo de presidente dos EUA, e foge com Ocelot.

Ocelot implanta a mão de Liquid Snake em seu corpo. Após a operação de implante, parece que a psique de Liquid Snake está tentando tomar controle do corpo de Ocelot.

Solid Snake e Otacon criam Philanthropy, uma ONG destinada a cessar o desenvolvimento de novos modelos de Metal Gear.

Solid Snake e Otacon descobrem que um novo Metal Gear, chamado Metal Gear Ray, está sendo transportado através dos EUA em um navio-tanque. A informação foi passada por Emma Emmerich, meia-irmã de Otacon.

A missão de Solid Snake é se infiltrar no navio-tanque e tirar fotos do novo Metal Gear para provar sua existência ao mundo.

Logo que Solid Snake embarca no navio-tanque, uma força militar russa assume seu controle. É o grupo mercenário liderado desde 1991 por Sergei Gurlukovich.

Solid Snake se encontra e luta contra a filha de Sergei Gurlukovich, Olga Gurlukovich, que decidiu permanecer no navio-tanque embora estivesse grávida.

Após derrotar Olga, um drone americano aparece no céu e fotografa Solid Snake, que agora pode ser incriminado pelos EUA.

Solid Snake se infiltra no navio e tira fotos do Metal Gear enquanto o comandante dos Fuzileiros Navais dos Estados Unidos, Scott Dolph, dá um discurso a seus soldados.

Após o discurso, para a surpresa de todos, Revolver Ocelot aparece, revelando seu plano de levar Metal Gear RAY.

Sergei Gurlukovich também aparece, e toma Scott Dolph como refém.

Sergei Gurlukovich explica que eles pretendiam tomar o Metal Gear RAY e vendê-lo para a Rússia para revivê-la à sua antiga glória.

Mais uma vez para a surpresa de todos, Ocelot revela que este não é seu plano. Sergei Gurlukovich suspeita que Ocelot ainda esteja trabalhando ao lado de Solidus Snake, e Ocelot revela que está trabalhando para os Patriotas.

Sergei Gurlukovich enraivece por causa da traição de Ocelot e tenta atirar nele, mas Ocelot é muito mais rápido ao sacar a arma. Ocelot mata Gurlukovich, seus soldados e Scott Dolph. Após isto, ele aciona os explosivos plantados no navio-tanque e foge no Metal Gear RAY.

Solid Snake é acusado de roubar o Metal Gear RAY, e portanto forçado a se esconder.

Manipulada pelos Patriotas, a mídia relata que Solid Snake liderara o domínio terrorista do navio-tanque e que, temendo um desastre natural, a Marinha despachara os Fuzileiros Navais para acabar com a ameaça. A mídia diz que Snake terminara afundando o navio e matando todos envolvidos, incluindo a si próprio. A limpeza do local que seria necessária deu aos Patriotas a desculpa perfeita para a construção de Big Shell.

Olga Gurlukovich toma a liderança do exército de seu pai. Ela dá a luz a sua filha Sunny, que é tomada refém pelos Patriotas de forma a forçá-la a servi-los.

Vem à tona que um grupo terrorista autointitulado Filhos da Liberdade está mantendo reféns dentro de Big Shell. O líder do grupo afirma ser Solid Snake. Entre os reféns, está o 44º presidente dos EUA, James Johnson. Os Filhos da Liberdade requerem 30 bilhões de cólares, e afirmam que caso suas exigências não sejam atendidas, eles destruirão Big Shell, criando uma catástrofe ecológica incrível.

FOXHOUND envia o agente Raiden para Big Shell para salvar os reféns. Aqui, ele é ajudado por um homem chamado Iroquois Pliskin.

Após um encontro com o líder dos Filhos da Liberdade, fica claro que ele é Solidus Snake, mas afirmou ser Solid Snake para incriminá-lo novamente. Pliskin revela ser Solid Snake.

Durante a missão, Raiden descobre que Big Shell é nada mais do que um Metal Gear enorme chamado Arsenal Gear. O Arsenal Gear, acima disso, contém a IA dos Patriotas.

Raiden e Solid Snake, com a ajuda de Otacon e de sua meia-irmã Emma Emmerich, conseguem instalar um vírus dentro da IA dos Patriotas.

Emma Emmerich é morta por Vamp, um dos membros dos Filhos da Liberdade.

Ocelot retorna, revelando que toda a missão de Raiden tinha sido uma grande simulação orquestrada pela IA dos Patriotas. O objetivo da missão era recriar os eventos de Shadow Moses e então moldar um novo super soldado tão bom quanto Solid Snake.

A IA dos Patriotas entra em contato com Raiden e pede-lhe que mate Solidus Snake, caso contrário eles matarão o amor de Raiden, Rosemary.

Raiden eventualmente chega ao núcleo do Arsenal Gear onde luta contra uma série de Metal Gear RAYs, encontrando Solidus Snake após. Solidus Snake revela a Raiden que ele era seu pai adotivo.

Raiden segue as ordens da IA dos Patriotas e mata Solidus Snake. Enfurecido por ter sido manipulado, ele jura encontrar e destruir os Patriotas.

Os Patriotas completam a construção do navio de guerra do Arsenal Gear. O navio de guerra logo é roubado por Ocelot, que o renomeia Outer Haven, como uma referência para o próprio grupo militar de Big Boss. Ocelot esconde o navio em Shadow Moses e consegue instalar nele a IA recuperada do Arsenal Gear original.

Raiden resgata Sunny dos Patriotas. Logo depois, Sunny começa a viver sob a proteção de Otacon.

Agora, Ocelot é totalmente controlado por Liquid Snake, e é chamado de Liquid Ocelot. Solid Snake, que está envelhecendo muito rápido, é chamado de Old Snake.

O mundo agora é controlado por companhias militares privadas (CMPs), compostas por soldados melhorados por nanomáquinas. De todas, a maior CMP é a comandada por Liquid Ocelot.

As Nações Unidas querem que Liquid Ocelot seja assassinado, e graças às palavras convincentes de Roy Campbell, Snake decide começar uma missão com a ajuda, mais uma vez, de Otacon. Junto deles está Sunny, a filha de Olga Gurlukovich.

A primeira tentativa de Snake de matar Liquid Ocelot falha, mas ele descobre que a Dra. Naomi Hunter está sendo mantida em cativeiro por Liquid Ocelot.

Snake resgata Naomi Hunter, que explica a ele que o vírus FOXDIE em seu corpo está entrando em mutação. Ela também lhe conta o objetivo de Liquid Ocelot: ele deseja obter o corpo de Big Boss e usar suas informações biométricas para acessar a IA mestre dos Patriotas. Isto lhe garantirá controle de todas as nanomáquinas no mundo e, portanto, de todas as CMPs.

Snake batalha contra uma série de robôs, com a ajuda do Ninja Ciborgue, que é revelado ser Raiden.

Liquid Ocelot obtém o corpo de Big Boss e desliga cada CMP do mundo, incluindo a sua. Seu plano era agora o de destruir os Patriotas e para isso, ele precisa novamente ganhar acesso à única arma nuclear que não era controlada pelos Patriotas: o Metal Gear REX, em Shadow Moses

Snake se infiltra em Shadow Moses e consegue ganhar controle do Metal Gear REX antes de Liquid Ocelot, que eventualmente toma controle do Metal Gear RAY. Eles começam um duelo de robôs que termina com ambos sériamente feridos.

Liquid Ocelot salta para dentro de Outer Haven e Snake, junto a Raiden e a unidade Rat Patrol, o segue um pouco depois.

Após ultrapassarem o sistema de defesa de microondas de Outer Haven, Snake impede o lançamento do canhão elétrico usando o vírus FOXALIVE criado por Naomi Hunter e Sunny. O vírus destrói o sistema dos Patriotas, que por sua vez destrói todas as IAs e nanomáquinas do mundo. O mundo está livre dos Patriotas.

Liquid Ocelot revela que utilizar o FOXALIVE estava em seu plano desde o princípio, para concluir à sua maneira o sonho de Big Boss. Liquid Ocelot e Snake batalham seu último duelo, no qual Liquid Ocelot morre.

Snake visita o túmulo de Big Boss. Com apenas um ano de vida e o vírus FOXDIE sofrendo mutações e ameaçando matar todos a sua volta, ele decide cometer suicídio.

Antes que puxasse o gatilho, ele é impedido por um homem que empurrava outro em uma cadeira de rodas. Esse homem era Big Boss, empurrando com ele o agora paralisado Major Zero.

Big Boss explica que o corpo congelado, utilizado por Liquid Ocelot, era na verdade de Solidus Snake e funcionou porque ele era seu clone perfeito.

Big Boss explica que Major Zero eventualmente deixou a IA tomar controle dos Patriotas, que levou o mundo para a dependência da economia de guerra.

Big Boss está ciente de que essa visão diverge fortemente da visão de The Boss sobre o mundo. Após, Big Boss desliga o suprimento de oxigênio que mantinha Major Zero vivo.

Após Snake e Big Boss se reconciliarem, Big Boss morre em seus braços.

Raiden se junta a uma organização de segurança privada chamada Maverick. Seus objetivos são de proteger os fracos e qualquer outro que precise de suporte militar.

Na África, o primeiro-ministro de uma nação estava tentando reconstruí-la, após os danos causados pela guerra civil. Um dia, ele é atacado por uma CMP chamada Desperado, que o leva como refém.

Raiden segue os sequestradores, mas o primeiro-ministro é eventualmente morto. Raiden luta contra Sam Rodriguez, um poderoso ninja ciborgue. Raiden é derrotado e perde um olho e um braço.

Maverick é chamada para intervir em Abkhazia, onde um grupo estava tentando derrubar o governo. Maverick envia Raiden - agora recuperado da batalha - para capturar o líder deste grupo, Andrey Dolzaev.

Raiden encontra evidências de que Desperado - a CMP que atacou o primeiro-ministro - também estava cooperando com este grupo em Abkhazia e planejando um ataque.

Raiden é enviado para o México, onde Desperado possui um laboratório cibernético. Ele logo descobre que nesse laboratório diversas crianças eram mantidas sequestradas, e seus cérebros estavam sendo removidos para serem treinadas virtualmente e se tornarem soldados-cibernéticos para World Marshal, uma CMP americana.

Maverick não possui permissão para atacar World Marshal, então Raiden - irritado com que eles fizeram com as crianças - parte sozinho em uma missão de encontrar o quartel general da World Marshal.

Raiden chega ao quartel general e derrota Sundowner, líder da CMP que matou o primeiro-ministro africano. Raiden descobre que o ataque é ligado diretamente ao presidente dos Estados Unidos Hemilton, que está visitando o Paquistão. Esse se torna o próximo destino de Raiden.

Por causa de um ataque inimigo, Raiden é forçado a deixar o helicóptero em que estava. Ele agora precisa encontrar Solis, uma empresa privada de vôo espacial que poderia permitir-lhe viajar mais rápido para o Paquistão e impedir o ataque ao presidente.

Raiden se encontra novamente com Sam Rodriguez. Eles batalham, porém dessa vez Raiden vence.

Raiden finalmente alcança Solis, onde Sunny está trabalhando. O lançamento é um sucesso e Raiden chega ao Paquistão.

Raiden descobre que quem estava por trás do ataque era Steven Armstrong, o senador do Colorado. Armstrong, controlando um novo Metal Gear - nomeado EXCELSUS - quer começar uma guerra entre os EUA e o Paquistão, revitalizar a economia de guerra e usar isto como um golpe político para se tornar presidente

Raiden primeiramente destrói o Metal Gear EXCELSUS e logo após, batalha e derrota Armstrong.

A guerra é impedida, mas a tensão entre os EUA e o Paquistão continua alta.

Maverick se torna a maior empresa cibernética, utilizando os cérebros para produzir trabalhadores e enfermeiras.

Raiden decide começar uma batalha contra as CMPs corruptas independentemente.

The end

About the project

I'm Alex, game designer and huge Metal Gear fanboy.

Every time a new Metal Gear is about to be released, I have to reorganize all my thoughts and memories, which is usually a tiring task. I started looking for accessible ways to have an overview of the different game events, but I figured out that there was no such a thing available.

I therefore decided to spend some of my spare time creating the Metal Gear Timeline: I hope you will like it and find it useful (whether you love or hate this crazy saga).

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